Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Treml4Q3LRV9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Treml4Q3LRV9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Treml4Q3LRV9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Treml4Q3LRV9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Treml4Q3LRV9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Treml4Q3LRV9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Treml4Q3LRV9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Treml4Q3LRV9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Treml4Q3LRV9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Treml4Q3LRV9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Treml4Q3LRV9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Treml4Q3LRV9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Treml4Q3LRV9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Treml4Q3LRV9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Treml4Q3LRV9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Treml4Q3LRV9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Treml4Q3LRV9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Treml4Q3LRV9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Treml4Q3LRV9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Treml4Q3LRV9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Treml4Q3LRV9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Treml4Q3LRV9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Treml4Q3LRV9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Treml4Q3LRV9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Treml4Q3LRV9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Treml4Q3LRV9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Treml4Q3LRV9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Treml4Q3LRV9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Treml4Q3LRV9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Treml4Q3LRV9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Treml4Q3LRV9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Treml4Q3LRV9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Treml4Q3LRV9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Treml4Q3LRV9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Treml4Q3LRV9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Treml4Q3LRV9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Treml4Q3LRV9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Treml4Q3LRV9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Treml4Q3LRV9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Treml4Q3LRV9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Treml4Q3LRV9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Treml4Q3LRV9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Treml4Q3LRV9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Treml4Q3LRV9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Treml4Q3LRV9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Treml4Q3LRV9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Treml4Q3LRV9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Treml4Q3LRV9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Treml4Q3LRV9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Treml4Q3LRV9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Treml4Q3LRV9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Treml4Q3LRV9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Treml4Q3LRV9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Treml4Q3LRV9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Treml4Q3LRV9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Treml4Q3LRV9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Treml4Q3LRV9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Treml4Q3LRV9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Treml4Q3LRV9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Treml4Q3LRV9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Treml4Q3LRV9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Treml4Q3LRV9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Treml4Q3LRV9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Treml4Q3LRV9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Treml4Q3LRV9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Treml4Q3LRV9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Treml4Q3LRV9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Treml4Q3LRV9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Treml4Q3LRV9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Treml4Q3LRV9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Treml4Q3LRV9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Treml4Q3LRV9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Treml4Q3LRV9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Treml4Q3LRV9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Treml4Q3LRV9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Treml4Q3LRV9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Treml4Q3LRV9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Treml4Q3LRV9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Treml4Q3LRV9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Treml4Q3LRV9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Treml4Q3LRV9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Treml4Q3LRV9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Treml4Q3LRV9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Treml4Q3LRV9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Treml4Q3LRV9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Treml4Q3LRV9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Treml4Q3LRV9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Treml4Q3LRV9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Treml4Q3LRV9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Treml4Q3LRV9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Treml4Q3LRV9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Treml4Q3LRV9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Treml4Q3LRV9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms