Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim63Q38HM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim63Q38HM4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim63Q38HM4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim63Q38HM4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim63Q38HM4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim63Q38HM4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim63Q38HM4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim63Q38HM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim63Q38HM4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim63Q38HM4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim63Q38HM4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim63Q38HM4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim63Q38HM4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim63Q38HM4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim63Q38HM4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim63Q38HM4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim63Q38HM4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim63Q38HM4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim63Q38HM4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim63Q38HM4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim63Q38HM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim63Q38HM4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim63Q38HM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim63Q38HM4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim63Q38HM4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim63Q38HM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim63Q38HM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim63Q38HM4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim63Q38HM4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim63Q38HM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim63Q38HM4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim63Q38HM4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim63Q38HM4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim63Q38HM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim63Q38HM4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim63Q38HM4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim63Q38HM4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim63Q38HM4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim63Q38HM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim63Q38HM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim63Q38HM4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim63Q38HM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim63Q38HM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim63Q38HM4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim63Q38HM4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim63Q38HM4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim63Q38HM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim63Q38HM4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim63Q38HM4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim63Q38HM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim63Q38HM4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim63Q38HM4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim63Q38HM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim63Q38HM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim63Q38HM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim63Q38HM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim63Q38HM4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim63Q38HM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim63Q38HM4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim63Q38HM4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim63Q38HM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim63Q38HM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim63Q38HM4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim63Q38HM4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim63Q38HM4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim63Q38HM4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim63Q38HM4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim63Q38HM4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms