Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX9

C2orf68, UPF0561 protein C2orf68, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf68Q2NKX9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf68Q2NKX9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf68Q2NKX9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf68Q2NKX9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf68Q2NKX9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf68Q2NKX9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf68Q2NKX9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf68Q2NKX9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf68Q2NKX9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf68Q2NKX9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf68Q2NKX9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf68Q2NKX9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf68Q2NKX9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf68Q2NKX9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf68Q2NKX9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf68Q2NKX9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf68Q2NKX9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf68Q2NKX9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf68Q2NKX9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf68Q2NKX9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf68Q2NKX9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf68Q2NKX9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf68Q2NKX9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf68Q2NKX9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2orf68Q2NKX9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf68Q2NKX9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf68Q2NKX9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf68Q2NKX9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf68Q2NKX9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf68Q2NKX9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf68Q2NKX9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf68Q2NKX9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf68Q2NKX9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf68Q2NKX9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf68Q2NKX9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf68Q2NKX9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf68Q2NKX9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf68Q2NKX9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf68Q2NKX9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf68Q2NKX9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf68Q2NKX9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf68Q2NKX9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf68Q2NKX9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf68Q2NKX9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf68Q2NKX9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf68Q2NKX9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf68Q2NKX9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C2orf68Q2NKX9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf68Q2NKX9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf68Q2NKX9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf68Q2NKX9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf68Q2NKX9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf68Q2NKX9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf68Q2NKX9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf68Q2NKX9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf68Q2NKX9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf68Q2NKX9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf68Q2NKX9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf68Q2NKX9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf68Q2NKX9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf68Q2NKX9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf68Q2NKX9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf68Q2NKX9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C2orf68Q2NKX9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf68Q2NKX9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf68Q2NKX9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf68Q2NKX9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf68Q2NKX9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf68Q2NKX9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf68Q2NKX9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf68Q2NKX9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf68Q2NKX9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf68Q2NKX9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf68Q2NKX9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf68Q2NKX9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf68Q2NKX9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf68Q2NKX9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf68Q2NKX9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf68Q2NKX9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms