Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSG1Q2KHT4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSG1Q2KHT4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSG1Q2KHT4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GSG1Q2KHT4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSG1Q2KHT4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSG1Q2KHT4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSG1Q2KHT4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSG1Q2KHT4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSG1Q2KHT4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSG1Q2KHT4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSG1Q2KHT4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSG1Q2KHT4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSG1Q2KHT4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSG1Q2KHT4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSG1Q2KHT4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSG1Q2KHT4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSG1Q2KHT4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSG1Q2KHT4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSG1Q2KHT4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSG1Q2KHT4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GSG1Q2KHT4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSG1Q2KHT4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSG1Q2KHT4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSG1Q2KHT4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSG1Q2KHT4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSG1Q2KHT4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSG1Q2KHT4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSG1Q2KHT4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSG1Q2KHT4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSG1Q2KHT4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSG1Q2KHT4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSG1Q2KHT4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSG1Q2KHT4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSG1Q2KHT4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSG1Q2KHT4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSG1Q2KHT4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSG1Q2KHT4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSG1Q2KHT4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSG1Q2KHT4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSG1Q2KHT4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSG1Q2KHT4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSG1Q2KHT4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSG1Q2KHT4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSG1Q2KHT4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSG1Q2KHT4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSG1Q2KHT4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSG1Q2KHT4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSG1Q2KHT4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSG1Q2KHT4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSG1Q2KHT4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GSG1Q2KHT4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSG1Q2KHT4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSG1Q2KHT4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSG1Q2KHT4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSG1Q2KHT4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSG1Q2KHT4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSG1Q2KHT4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSG1Q2KHT4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms