Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
Shroom4Q1W617 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Shroom4Q1W617 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Shroom4Q1W617 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Shroom4Q1W617 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Shroom4Q1W617 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
Shroom4Q1W617 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
Shroom4Q1W617 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC46.07■■■■■ 4.96
Shroom4Q1W617 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Shroom4Q1W617 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
Shroom4Q1W617 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
Shroom4Q1W617 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
Shroom4Q1W617 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
Shroom4Q1W617 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC45.88■■■■■ 4.93
Shroom4Q1W617 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Shroom4Q1W617 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Shroom4Q1W617 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Shroom4Q1W617 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Shroom4Q1W617 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Shroom4Q1W617 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Shroom4Q1W617 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Shroom4Q1W617 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Shroom4Q1W617 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Shroom4Q1W617 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Shroom4Q1W617 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Shroom4Q1W617 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC45.33■■■■■ 4.85
Shroom4Q1W617 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Shroom4Q1W617 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Shroom4Q1W617 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Shroom4Q1W617 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Shroom4Q1W617 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Shroom4Q1W617 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
Shroom4Q1W617 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Shroom4Q1W617 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Shroom4Q1W617 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Shroom4Q1W617 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Shroom4Q1W617 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Shroom4Q1W617 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Shroom4Q1W617 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Shroom4Q1W617 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Shroom4Q1W617 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Shroom4Q1W617 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Shroom4Q1W617 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Shroom4Q1W617 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Shroom4Q1W617 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Shroom4Q1W617 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Shroom4Q1W617 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Shroom4Q1W617 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Shroom4Q1W617 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Shroom4Q1W617 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Shroom4Q1W617 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Shroom4Q1W617 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Shroom4Q1W617 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Shroom4Q1W617 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Shroom4Q1W617 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Shroom4Q1W617 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Shroom4Q1W617 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Shroom4Q1W617 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Shroom4Q1W617 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
Shroom4Q1W617 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Shroom4Q1W617 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
Shroom4Q1W617 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Shroom4Q1W617 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Shroom4Q1W617 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
Shroom4Q1W617 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Shroom4Q1W617 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
Shroom4Q1W617 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Shroom4Q1W617 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Shroom4Q1W617 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Shroom4Q1W617 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Shroom4Q1W617 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Shroom4Q1W617 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Shroom4Q1W617 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Shroom4Q1W617 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Shroom4Q1W617 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Shroom4Q1W617 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
Shroom4Q1W617 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Shroom4Q1W617 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Shroom4Q1W617 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Shroom4Q1W617 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms