Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 TPR-208ENST00000492973 453 ntTSL 25.89□□□□□ -1.472e-10■■■■■ 37.7
SRSF7Q16629 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 37.5
SRSF7Q16629 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 37.5
SRSF7Q16629 SLC17A9-207ENST00000488738 3992 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 37.5
SRSF7Q16629 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 211.48□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 37.3
SRSF7Q16629 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 214.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 36.7
SRSF7Q16629 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 36.7
SRSF7Q16629 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 36.7
SRSF7Q16629 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 36.7
SRSF7Q16629 QRICH2-204ENST00000532549 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.52□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 36.5
SRSF7Q16629 QRICH2-202ENST00000447564 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.34□□□□□ -0.272e-10■■■■■ 36.5
SRSF7Q16629 PPARGC1A-204ENST00000506055 2627 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 36.5
SRSF7Q16629 PLCB1-220ENST00000630757 857 ntTSL 36.32□□□□□ -1.45e-11■■■■■ 36.2
SRSF7Q16629 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 52.95□□□□□ -1.945e-11■■■■■ 36.2
SRSF7Q16629 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 36.1
SRSF7Q16629 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.262e-9■■■■■ 35.6
SRSF7Q16629 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 46.89□□□□□ -1.312e-9■■■■■ 35.6
SRSF7Q16629 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.38e-11■■■■■ 35.4
SRSF7Q16629 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 513.42□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.58e-11■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.28e-11■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.44e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 29.81□□□□□ -0.844e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-206ENST00000487231 3088 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.914e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-207ENST00000492429 2658 ntTSL 29.34□□□□□ -0.914e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.168e-11■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 25.27□□□□□ -1.572e-12■■■■■ 35.1
SRSF7Q16629 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 34.6
SRSF7Q16629 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 34.6
SRSF7Q16629 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 34.6
SRSF7Q16629 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 34.6
SRSF7Q16629 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC10.93□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-221ENST00000513230 248 ntTSL 318.93■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 417.46■□□□□ 0.391e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-245ENST00000523137 1563 ntTSL 415.89■□□□□ 0.131e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-228ENST00000515714 690 ntTSL 414.59□□□□□ -0.071e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-212ENST00000505087 592 ntTSL 313.51□□□□□ -0.251e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 313.51□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-208ENST00000503664 569 ntTSL 413.06□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 33.9
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SRSF7Q16629 HNRNPH1-225ENST00000515158 850 ntTSL 412.15□□□□□ -0.461e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-242ENST00000522256 492 ntTSL 412.02□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-213ENST00000505811 1155 ntTSL 511.93□□□□□ -0.51e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-224ENST00000514731 1371 ntTSL 211.7□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-220ENST00000513225 805 ntTSL 411.53□□□□□ -0.561e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 211.42□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-215ENST00000508103 610 ntTSL 210.65□□□□□ -0.71e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-217ENST00000510431 620 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-234ENST00000519707 582 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 510.62□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-233ENST00000519455 451 ntTSL 410.4□□□□□ -0.741e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-222ENST00000513972 761 ntTSL 210.36□□□□□ -0.751e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-214ENST00000506721 602 ntTSL 510.29□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-209ENST00000504348 594 ntTSL 410.29□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-232ENST00000519056 530 ntTSL 49.24□□□□□ -0.931e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-219ENST00000512273 501 ntTSL 46.81□□□□□ -1.321e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.813e-10■■■■■ 33.8
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SRSF7Q16629 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.773e-10■■■■■ 33.8
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SRSF7Q16629 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.583e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-218ENST00000523328 343 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.43e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.213e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-220ENST00000524165 458 ntTSL 213.59□□□□□ -0.233e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 411.72□□□□□ -0.533e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 211.27□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.743e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 210.1□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-215ENST00000522963 568 ntTSL 49.78□□□□□ -0.843e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 59.36□□□□□ -0.913e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 58.68□□□□□ -1.023e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 48.58□□□□□ -1.043e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-216ENST00000523068 844 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.053e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-207ENST00000518528 624 ntTSL 36.94□□□□□ -1.33e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-205ENST00000517790 599 ntTSL 24.2□□□□□ -1.743e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 216.24■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 414.81□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 213.32□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 312.38□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 412.25□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 411.81□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 411.59□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 411.08□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-218ENST00000574804 631 ntTSL 310.45□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 39.59□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-223ENST00000575958 567 ntTSL 49.41□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 33.7
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