Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX1Q16384 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX1Q16384 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSX1Q16384 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSX1Q16384 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSX1Q16384 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSX1Q16384 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX1Q16384 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX1Q16384 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX1Q16384 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX1Q16384 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX1Q16384 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSX1Q16384 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX1Q16384 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX1Q16384 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX1Q16384 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX1Q16384 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSX1Q16384 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSX1Q16384 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSX1Q16384 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSX1Q16384 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSX1Q16384 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSX1Q16384 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX1Q16384 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX1Q16384 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSX1Q16384 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSX1Q16384 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSX1Q16384 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSX1Q16384 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSX1Q16384 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSX1Q16384 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX1Q16384 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSX1Q16384 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSX1Q16384 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSX1Q16384 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSX1Q16384 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX1Q16384 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX1Q16384 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX1Q16384 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX1Q16384 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX1Q16384 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX1Q16384 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSX1Q16384 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX1Q16384 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSX1Q16384 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSX1Q16384 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX1Q16384 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX1Q16384 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX1Q16384 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX1Q16384 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSX1Q16384 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSX1Q16384 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX1Q16384 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX1Q16384 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX1Q16384 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSX1Q16384 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSX1Q16384 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX1Q16384 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSX1Q16384 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSX1Q16384 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX1Q16384 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSX1Q16384 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSX1Q16384 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSX1Q16384 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSX1Q16384 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX1Q16384 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX1Q16384 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX1Q16384 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX1Q16384 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX1Q16384 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX1Q16384 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX1Q16384 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX1Q16384 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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