Protein–RNA interactions for Protein: Q15800

MSMO1, Methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1Q15800 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSMO1Q15800 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSMO1Q15800 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSMO1Q15800 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSMO1Q15800 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSMO1Q15800 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSMO1Q15800 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSMO1Q15800 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSMO1Q15800 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSMO1Q15800 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSMO1Q15800 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSMO1Q15800 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSMO1Q15800 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSMO1Q15800 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSMO1Q15800 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MSMO1Q15800 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSMO1Q15800 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSMO1Q15800 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSMO1Q15800 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSMO1Q15800 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSMO1Q15800 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSMO1Q15800 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSMO1Q15800 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSMO1Q15800 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSMO1Q15800 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSMO1Q15800 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSMO1Q15800 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSMO1Q15800 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSMO1Q15800 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSMO1Q15800 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSMO1Q15800 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSMO1Q15800 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSMO1Q15800 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSMO1Q15800 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSMO1Q15800 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSMO1Q15800 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSMO1Q15800 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSMO1Q15800 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSMO1Q15800 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSMO1Q15800 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSMO1Q15800 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSMO1Q15800 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSMO1Q15800 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSMO1Q15800 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSMO1Q15800 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMO1Q15800 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMO1Q15800 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MSMO1Q15800 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSMO1Q15800 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSMO1Q15800 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSMO1Q15800 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSMO1Q15800 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSMO1Q15800 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSMO1Q15800 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSMO1Q15800 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSMO1Q15800 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms