Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NECTIN1Q15223 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NECTIN1Q15223 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NECTIN1Q15223 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NECTIN1Q15223 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NECTIN1Q15223 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NECTIN1Q15223 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NECTIN1Q15223 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NECTIN1Q15223 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NECTIN1Q15223 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NECTIN1Q15223 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NECTIN1Q15223 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NECTIN1Q15223 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NECTIN1Q15223 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NECTIN1Q15223 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NECTIN1Q15223 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NECTIN1Q15223 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NECTIN1Q15223 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NECTIN1Q15223 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NECTIN1Q15223 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NECTIN1Q15223 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NECTIN1Q15223 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NECTIN1Q15223 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NECTIN1Q15223 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NECTIN1Q15223 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NECTIN1Q15223 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NECTIN1Q15223 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NECTIN1Q15223 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NECTIN1Q15223 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NECTIN1Q15223 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NECTIN1Q15223 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NECTIN1Q15223 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NECTIN1Q15223 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NECTIN1Q15223 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NECTIN1Q15223 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NECTIN1Q15223 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NECTIN1Q15223 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NECTIN1Q15223 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NECTIN1Q15223 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NECTIN1Q15223 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NECTIN1Q15223 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NECTIN1Q15223 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NECTIN1Q15223 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NECTIN1Q15223 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NECTIN1Q15223 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NECTIN1Q15223 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NECTIN1Q15223 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NECTIN1Q15223 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NECTIN1Q15223 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NECTIN1Q15223 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NECTIN1Q15223 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NECTIN1Q15223 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NECTIN1Q15223 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NECTIN1Q15223 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NECTIN1Q15223 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NECTIN1Q15223 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NECTIN1Q15223 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NECTIN1Q15223 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NECTIN1Q15223 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NECTIN1Q15223 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NECTIN1Q15223 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NECTIN1Q15223 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NECTIN1Q15223 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NECTIN1Q15223 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NECTIN1Q15223 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NECTIN1Q15223 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NECTIN1Q15223 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NECTIN1Q15223 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NECTIN1Q15223 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NECTIN1Q15223 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms