Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD1Q15116 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD1Q15116 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD1Q15116 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD1Q15116 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD1Q15116 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD1Q15116 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD1Q15116 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD1Q15116 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD1Q15116 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD1Q15116 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD1Q15116 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD1Q15116 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCD1Q15116 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD1Q15116 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD1Q15116 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCD1Q15116 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD1Q15116 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD1Q15116 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD1Q15116 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD1Q15116 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD1Q15116 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD1Q15116 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD1Q15116 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD1Q15116 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCD1Q15116 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCD1Q15116 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCD1Q15116 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD1Q15116 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCD1Q15116 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD1Q15116 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD1Q15116 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD1Q15116 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD1Q15116 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD1Q15116 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD1Q15116 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD1Q15116 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD1Q15116 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDCD1Q15116 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCD1Q15116 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD1Q15116 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD1Q15116 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD1Q15116 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD1Q15116 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD1Q15116 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD1Q15116 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD1Q15116 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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