Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCA4Q14CN2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLCA4Q14CN2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCA4Q14CN2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLCA4Q14CN2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCA4Q14CN2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCA4Q14CN2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCA4Q14CN2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCA4Q14CN2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCA4Q14CN2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCA4Q14CN2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCA4Q14CN2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCA4Q14CN2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCA4Q14CN2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCA4Q14CN2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCA4Q14CN2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCA4Q14CN2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCA4Q14CN2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCA4Q14CN2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCA4Q14CN2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCA4Q14CN2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCA4Q14CN2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCA4Q14CN2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCA4Q14CN2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCA4Q14CN2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCA4Q14CN2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCA4Q14CN2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCA4Q14CN2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCA4Q14CN2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCA4Q14CN2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCA4Q14CN2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCA4Q14CN2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLCA4Q14CN2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCA4Q14CN2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCA4Q14CN2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCA4Q14CN2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCA4Q14CN2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCA4Q14CN2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCA4Q14CN2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCA4Q14CN2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCA4Q14CN2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCA4Q14CN2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCA4Q14CN2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCA4Q14CN2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCA4Q14CN2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCA4Q14CN2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCA4Q14CN2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCA4Q14CN2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCA4Q14CN2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCA4Q14CN2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCA4Q14CN2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLCA4Q14CN2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCA4Q14CN2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCA4Q14CN2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCA4Q14CN2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCA4Q14CN2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLCA4Q14CN2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLCA4Q14CN2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLCA4Q14CN2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLCA4Q14CN2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLCA4Q14CN2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCA4Q14CN2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCA4Q14CN2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCA4Q14CN2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLCA4Q14CN2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CLCA4Q14CN2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCA4Q14CN2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLCA4Q14CN2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CLCA4Q14CN2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCA4Q14CN2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCA4Q14CN2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCA4Q14CN2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
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