Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPNMBQ14956 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPNMBQ14956 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GPNMBQ14956 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GPNMBQ14956 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GPNMBQ14956 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GPNMBQ14956 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GPNMBQ14956 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GPNMBQ14956 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GPNMBQ14956 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GPNMBQ14956 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GPNMBQ14956 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GPNMBQ14956 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GPNMBQ14956 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GPNMBQ14956 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GPNMBQ14956 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GPNMBQ14956 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GPNMBQ14956 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GPNMBQ14956 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GPNMBQ14956 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GPNMBQ14956 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GPNMBQ14956 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GPNMBQ14956 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GPNMBQ14956 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
GPNMBQ14956 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
GPNMBQ14956 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GPNMBQ14956 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GPNMBQ14956 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GPNMBQ14956 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GPNMBQ14956 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GPNMBQ14956 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GPNMBQ14956 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GPNMBQ14956 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GPNMBQ14956 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
GPNMBQ14956 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPNMBQ14956 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPNMBQ14956 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GPNMBQ14956 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GPNMBQ14956 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GPNMBQ14956 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
GPNMBQ14956 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPNMBQ14956 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GPNMBQ14956 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GPNMBQ14956 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GPNMBQ14956 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GPNMBQ14956 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GPNMBQ14956 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GPNMBQ14956 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GPNMBQ14956 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GPNMBQ14956 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPNMBQ14956 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPNMBQ14956 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GPNMBQ14956 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GPNMBQ14956 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GPNMBQ14956 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GPNMBQ14956 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GPNMBQ14956 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GPNMBQ14956 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GPNMBQ14956 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GPNMBQ14956 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GPNMBQ14956 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GPNMBQ14956 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GPNMBQ14956 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GPNMBQ14956 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
GPNMBQ14956 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GPNMBQ14956 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GPNMBQ14956 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GPNMBQ14956 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GPNMBQ14956 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GPNMBQ14956 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GPNMBQ14956 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GPNMBQ14956 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GPNMBQ14956 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
GPNMBQ14956 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GPNMBQ14956 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GPNMBQ14956 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GPNMBQ14956 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GPNMBQ14956 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GPNMBQ14956 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GPNMBQ14956 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GPNMBQ14956 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GPNMBQ14956 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GPNMBQ14956 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GPNMBQ14956 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GPNMBQ14956 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GPNMBQ14956 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GPNMBQ14956 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GPNMBQ14956 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GPNMBQ14956 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GPNMBQ14956 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GPNMBQ14956 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GPNMBQ14956 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
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