Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GBX1Q14549 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GBX1Q14549 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBX1Q14549 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GBX1Q14549 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBX1Q14549 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBX1Q14549 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBX1Q14549 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBX1Q14549 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GBX1Q14549 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBX1Q14549 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBX1Q14549 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBX1Q14549 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBX1Q14549 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBX1Q14549 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBX1Q14549 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBX1Q14549 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBX1Q14549 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBX1Q14549 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBX1Q14549 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBX1Q14549 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBX1Q14549 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBX1Q14549 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GBX1Q14549 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBX1Q14549 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBX1Q14549 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBX1Q14549 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBX1Q14549 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBX1Q14549 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBX1Q14549 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBX1Q14549 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBX1Q14549 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBX1Q14549 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBX1Q14549 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBX1Q14549 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBX1Q14549 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBX1Q14549 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBX1Q14549 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBX1Q14549 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBX1Q14549 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBX1Q14549 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBX1Q14549 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBX1Q14549 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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GBX1Q14549 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBX1Q14549 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GBX1Q14549 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBX1Q14549 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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GBX1Q14549 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBX1Q14549 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBX1Q14549 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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GBX1Q14549 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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GBX1Q14549 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GBX1Q14549 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBX1Q14549 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBX1Q14549 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GBX1Q14549 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBX1Q14549 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBX1Q14549 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBX1Q14549 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GBX1Q14549 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBX1Q14549 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBX1Q14549 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBX1Q14549 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBX1Q14549 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
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