Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CUL4BQ13620 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUL4BQ13620 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUL4BQ13620 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUL4BQ13620 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUL4BQ13620 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUL4BQ13620 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUL4BQ13620 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CUL4BQ13620 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CUL4BQ13620 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CUL4BQ13620 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CUL4BQ13620 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CUL4BQ13620 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CUL4BQ13620 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CUL4BQ13620 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CUL4BQ13620 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CUL4BQ13620 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CUL4BQ13620 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CUL4BQ13620 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CUL4BQ13620 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CUL4BQ13620 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CUL4BQ13620 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CUL4BQ13620 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CUL4BQ13620 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CUL4BQ13620 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CUL4BQ13620 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CUL4BQ13620 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CUL4BQ13620 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CUL4BQ13620 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CUL4BQ13620 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CUL4BQ13620 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CUL4BQ13620 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CUL4BQ13620 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CUL4BQ13620 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CUL4BQ13620 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CUL4BQ13620 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CUL4BQ13620 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CUL4BQ13620 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CUL4BQ13620 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CUL4BQ13620 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CUL4BQ13620 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CUL4BQ13620 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CUL4BQ13620 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CUL4BQ13620 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CUL4BQ13620 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CUL4BQ13620 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CUL4BQ13620 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CUL4BQ13620 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CUL4BQ13620 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CUL4BQ13620 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CUL4BQ13620 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CUL4BQ13620 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CUL4BQ13620 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CUL4BQ13620 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CUL4BQ13620 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CUL4BQ13620 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CUL4BQ13620 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CUL4BQ13620 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CUL4BQ13620 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CUL4BQ13620 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CUL4BQ13620 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CUL4BQ13620 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CUL4BQ13620 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CUL4BQ13620 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CUL4BQ13620 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CUL4BQ13620 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CUL4BQ13620 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CUL4BQ13620 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CUL4BQ13620 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CUL4BQ13620 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CUL4BQ13620 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CUL4BQ13620 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
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