Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL3Q13618 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUL3Q13618 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUL3Q13618 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUL3Q13618 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CUL3Q13618 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CUL3Q13618 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUL3Q13618 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUL3Q13618 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CUL3Q13618 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL3Q13618 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL3Q13618 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL3Q13618 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL3Q13618 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL3Q13618 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL3Q13618 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL3Q13618 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL3Q13618 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL3Q13618 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL3Q13618 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL3Q13618 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL3Q13618 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL3Q13618 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL3Q13618 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL3Q13618 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL3Q13618 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL3Q13618 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL3Q13618 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL3Q13618 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL3Q13618 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL3Q13618 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL3Q13618 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL3Q13618 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL3Q13618 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL3Q13618 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL3Q13618 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL3Q13618 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL3Q13618 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL3Q13618 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL3Q13618 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL3Q13618 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL3Q13618 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CUL3Q13618 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUL3Q13618 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL3Q13618 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL3Q13618 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL3Q13618 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL3Q13618 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL3Q13618 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL3Q13618 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL3Q13618 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL3Q13618 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CUL3Q13618 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL3Q13618 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CUL3Q13618 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL3Q13618 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CUL3Q13618 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL3Q13618 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL3Q13618 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL3Q13618 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CUL3Q13618 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL3Q13618 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL3Q13618 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL3Q13618 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL3Q13618 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL3Q13618 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL3Q13618 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL3Q13618 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL3Q13618 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL3Q13618 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL3Q13618 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL3Q13618 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL3Q13618 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL3Q13618 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL3Q13618 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL3Q13618 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms