Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL1Q13616 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CUL1Q13616 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CUL1Q13616 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL1Q13616 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CUL1Q13616 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL1Q13616 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CUL1Q13616 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CUL1Q13616 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CUL1Q13616 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CUL1Q13616 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CUL1Q13616 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CUL1Q13616 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CUL1Q13616 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CUL1Q13616 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CUL1Q13616 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CUL1Q13616 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CUL1Q13616 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CUL1Q13616 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CUL1Q13616 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CUL1Q13616 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CUL1Q13616 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CUL1Q13616 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CUL1Q13616 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CUL1Q13616 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CUL1Q13616 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CUL1Q13616 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CUL1Q13616 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CUL1Q13616 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CUL1Q13616 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CUL1Q13616 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL1Q13616 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL1Q13616 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL1Q13616 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CUL1Q13616 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CUL1Q13616 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CUL1Q13616 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CUL1Q13616 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CUL1Q13616 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CUL1Q13616 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CUL1Q13616 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CUL1Q13616 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CUL1Q13616 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CUL1Q13616 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CUL1Q13616 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL1Q13616 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL1Q13616 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CUL1Q13616 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CUL1Q13616 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CUL1Q13616 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CUL1Q13616 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CUL1Q13616 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CUL1Q13616 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CUL1Q13616 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CUL1Q13616 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CUL1Q13616 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL1Q13616 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL1Q13616 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL1Q13616 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL1Q13616 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL1Q13616 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL1Q13616 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CUL1Q13616 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL1Q13616 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL1Q13616 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL1Q13616 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL1Q13616 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL1Q13616 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL1Q13616 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CUL1Q13616 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL1Q13616 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL1Q13616 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL1Q13616 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL1Q13616 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL1Q13616 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL1Q13616 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL1Q13616 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL1Q13616 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL1Q13616 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL1Q13616 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL1Q13616 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL1Q13616 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL1Q13616 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL1Q13616 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUL1Q13616 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CUL1Q13616 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL1Q13616 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL1Q13616 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUL1Q13616 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CUL1Q13616 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUL1Q13616 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms