Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LSAMPQ13449 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSAMPQ13449 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSAMPQ13449 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSAMPQ13449 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSAMPQ13449 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSAMPQ13449 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSAMPQ13449 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LSAMPQ13449 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSAMPQ13449 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSAMPQ13449 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSAMPQ13449 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSAMPQ13449 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSAMPQ13449 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSAMPQ13449 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSAMPQ13449 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSAMPQ13449 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms