Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECH1Q13011 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECH1Q13011 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECH1Q13011 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECH1Q13011 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECH1Q13011 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECH1Q13011 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECH1Q13011 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECH1Q13011 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECH1Q13011 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECH1Q13011 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECH1Q13011 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECH1Q13011 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECH1Q13011 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECH1Q13011 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ECH1Q13011 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ECH1Q13011 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECH1Q13011 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECH1Q13011 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECH1Q13011 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECH1Q13011 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECH1Q13011 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECH1Q13011 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECH1Q13011 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECH1Q13011 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECH1Q13011 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECH1Q13011 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECH1Q13011 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECH1Q13011 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECH1Q13011 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECH1Q13011 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECH1Q13011 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECH1Q13011 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECH1Q13011 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECH1Q13011 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECH1Q13011 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECH1Q13011 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECH1Q13011 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECH1Q13011 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECH1Q13011 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECH1Q13011 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECH1Q13011 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECH1Q13011 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECH1Q13011 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECH1Q13011 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECH1Q13011 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECH1Q13011 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECH1Q13011 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECH1Q13011 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECH1Q13011 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECH1Q13011 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECH1Q13011 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECH1Q13011 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECH1Q13011 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECH1Q13011 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECH1Q13011 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECH1Q13011 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECH1Q13011 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECH1Q13011 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECH1Q13011 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECH1Q13011 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECH1Q13011 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECH1Q13011 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECH1Q13011 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
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