Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NFIAQ12857 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NFIAQ12857 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NFIAQ12857 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NFIAQ12857 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NFIAQ12857 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NFIAQ12857 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NFIAQ12857 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NFIAQ12857 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NFIAQ12857 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NFIAQ12857 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NFIAQ12857 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NFIAQ12857 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NFIAQ12857 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NFIAQ12857 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NFIAQ12857 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NFIAQ12857 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NFIAQ12857 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NFIAQ12857 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NFIAQ12857 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NFIAQ12857 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NFIAQ12857 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NFIAQ12857 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NFIAQ12857 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NFIAQ12857 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NFIAQ12857 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NFIAQ12857 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NFIAQ12857 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NFIAQ12857 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NFIAQ12857 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NFIAQ12857 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NFIAQ12857 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NFIAQ12857 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NFIAQ12857 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NFIAQ12857 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NFIAQ12857 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NFIAQ12857 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NFIAQ12857 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NFIAQ12857 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NFIAQ12857 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NFIAQ12857 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NFIAQ12857 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NFIAQ12857 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NFIAQ12857 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NFIAQ12857 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NFIAQ12857 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NFIAQ12857 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NFIAQ12857 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NFIAQ12857 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NFIAQ12857 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NFIAQ12857 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NFIAQ12857 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NFIAQ12857 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NFIAQ12857 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NFIAQ12857 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NFIAQ12857 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NFIAQ12857 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NFIAQ12857 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NFIAQ12857 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NFIAQ12857 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NFIAQ12857 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NFIAQ12857 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NFIAQ12857 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NFIAQ12857 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NFIAQ12857 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NFIAQ12857 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NFIAQ12857 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NFIAQ12857 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NFIAQ12857 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NFIAQ12857 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NFIAQ12857 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NFIAQ12857 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NFIAQ12857 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NFIAQ12857 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NFIAQ12857 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NFIAQ12857 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NFIAQ12857 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NFIAQ12857 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NFIAQ12857 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NFIAQ12857 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NFIAQ12857 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NFIAQ12857 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NFIAQ12857 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NFIAQ12857 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFIAQ12857 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFIAQ12857 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFIAQ12857 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NFIAQ12857 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NFIAQ12857 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NFIAQ12857 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NFIAQ12857 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NFIAQ12857 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NFIAQ12857 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIAQ12857 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NFIAQ12857 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NFIAQ12857 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NFIAQ12857 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NFIAQ12857 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NFIAQ12857 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NFIAQ12857 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
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