Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 ART5YGR068C 1761 nt12.65□□□□□ -0.38
AVL9Q12500 YDL221WYDL221W 552 nt12.63□□□□□ -0.39
AVL9Q12500 GFD2YCL036W 1701 nt12.58□□□□□ -0.4
AVL9Q12500 TIR4YOR009W 1464 nt12.56□□□□□ -0.4
AVL9Q12500 YBR220CYBR220C 1683 nt12.54□□□□□ -0.4
AVL9Q12500 IRC15YPL017C 1500 nt12.53□□□□□ -0.4
AVL9Q12500 YJL152WYJL152W 360 nt12.53□□□□□ -0.4
AVL9Q12500 RTS2YOR077W 699 nt12.52□□□□□ -0.41
AVL9Q12500 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.51□□□□□ -0.41
AVL9Q12500 PET9YBL030C 957 nt12.51□□□□□ -0.41
AVL9Q12500 SDH1YKL148C 1923 nt12.5□□□□□ -0.41
AVL9Q12500 YMR057CYMR057C 372 nt12.48□□□□□ -0.41
AVL9Q12500 BDF1YLR399C 2061 nt12.47□□□□□ -0.41
AVL9Q12500 GIS3YLR094C 1509 nt12.47□□□□□ -0.41
AVL9Q12500 YCH1YGR203W 447 nt12.44□□□□□ -0.42
AVL9Q12500 WHI5YOR083W 888 nt12.44□□□□□ -0.42
AVL9Q12500 SCC4YER147C 1875 nt12.42□□□□□ -0.42
AVL9Q12500 YLR281CYLR281C 468 nt12.42□□□□□ -0.42
AVL9Q12500 CUE1YMR264W 612 nt12.31□□□□□ -0.44
AVL9Q12500 PUS2YGL063W 1113 nt12.3□□□□□ -0.44
AVL9Q12500 TAT1YBR069C 1860 nt12.29□□□□□ -0.44
AVL9Q12500 FPS1YLL043W 2010 nt12.28□□□□□ -0.44
AVL9Q12500 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.27□□□□□ -0.45
AVL9Q12500 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.27□□□□□ -0.45
AVL9Q12500 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.27□□□□□ -0.45
AVL9Q12500 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.27□□□□□ -0.45
AVL9Q12500 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.27□□□□□ -0.45
AVL9Q12500 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.27□□□□□ -0.45
AVL9Q12500 Q0182Q0182 405 nt12.25□□□□□ -0.45
AVL9Q12500 YIL100WYIL100W 354 nt12.2□□□□□ -0.46
AVL9Q12500 YLR236CYLR236C 324 nt12.19□□□□□ -0.46
AVL9Q12500 IDH1YNL037C 1083 nt12.18□□□□□ -0.46
AVL9Q12500 YSC84YHR016C 1407 nt12.16□□□□□ -0.46
AVL9Q12500 DSK2YMR276W 1122 nt12.14□□□□□ -0.47
AVL9Q12500 YPR011CYPR011C 981 nt12.14□□□□□ -0.47
AVL9Q12500 GBP2YCL011C 1284 nt12.14□□□□□ -0.47
AVL9Q12500 RRT12YCR045C 1476 nt12.14□□□□□ -0.47
AVL9Q12500 YNL195CYNL195C 786 nt12.09□□□□□ -0.47
AVL9Q12500 IMP2'YIL154C 1041 nt12.08□□□□□ -0.48
AVL9Q12500 YHL050CYHL050C 2094 nt12.07□□□□□ -0.48
AVL9Q12500 SEC11YIR022W 504 nt12.07□□□□□ -0.48
AVL9Q12500 PCH2YBR186W 1695 nt12.05□□□□□ -0.48
AVL9Q12500 YDR433WYDR433W 441 nt12.04□□□□□ -0.48
AVL9Q12500 RRD1YIL153W 1182 nt12.01□□□□□ -0.49
AVL9Q12500 FMP45YDL222C 930 nt12□□□□□ -0.49
AVL9Q12500 TCD2YKL027W 1344 nt12□□□□□ -0.49
AVL9Q12500 GUT2YIL155C 1950 nt11.98□□□□□ -0.49
AVL9Q12500 MXR2YCL033C 507 nt11.98□□□□□ -0.49
AVL9Q12500 DED1YOR204W 1815 nt11.96□□□□□ -0.49
AVL9Q12500 LPX1YOR084W 1164 nt11.95□□□□□ -0.5
AVL9Q12500 PAC11YDR488C 1602 nt11.94□□□□□ -0.5
AVL9Q12500 FMT1YBL013W 1206 nt11.88□□□□□ -0.51
AVL9Q12500 ERV46YAL042W 1248 nt11.87□□□□□ -0.51
AVL9Q12500 YKR040CYKR040C 504 nt11.85□□□□□ -0.51
AVL9Q12500 FMP52YER004W 696 nt11.82□□□□□ -0.52
AVL9Q12500 CWP1YKL096W 720 nt11.82□□□□□ -0.52
AVL9Q12500 ADH2YMR303C 1047 nt11.8□□□□□ -0.52
AVL9Q12500 PCM1YEL058W 1674 nt11.79□□□□□ -0.52
AVL9Q12500 RTF1YGL244W 1677 nt11.79□□□□□ -0.52
AVL9Q12500 PIB2YGL023C 1908 nt11.79□□□□□ -0.52
AVL9Q12500 YCL042WYCL042W 360 nt11.77□□□□□ -0.53
AVL9Q12500 BOP3YNL042W 1191 nt11.74□□□□□ -0.53
AVL9Q12500 FRD1YEL047C 1413 nt11.72□□□□□ -0.53
AVL9Q12500 LCB1YMR296C 1677 nt11.71□□□□□ -0.53
AVL9Q12500 SNF6YHL025W 999 nt11.7□□□□□ -0.54
AVL9Q12500 SPP1YPL138C 1062 nt11.7□□□□□ -0.54
AVL9Q12500 SIM1YIL123W 1431 nt11.69□□□□□ -0.54
AVL9Q12500 NCP1YHR042W 2076 nt11.69□□□□□ -0.54
AVL9Q12500 SOR2YDL246C 1074 nt11.69□□□□□ -0.54
AVL9Q12500 SOR1YJR159W 1074 nt11.69□□□□□ -0.54
AVL9Q12500 MOT3YMR070W 1473 nt11.69□□□□□ -0.54
AVL9Q12500 NVJ2YPR091C 2313 nt11.62□□□□□ -0.55
AVL9Q12500 PTK1YKL198C 1989 nt11.61□□□□□ -0.55
AVL9Q12500 BIO4YNR057C 714 nt11.6□□□□□ -0.55
AVL9Q12500 PTH1YHR189W 573 nt11.56□□□□□ -0.56
AVL9Q12500 YIH1YCR059C 777 nt11.52□□□□□ -0.57
AVL9Q12500 RNQ1YCL028W 1218 nt11.51□□□□□ -0.57
AVL9Q12500 YLL053CYLL053C 459 nt11.5□□□□□ -0.57
AVL9Q12500 DIC1YLR348C 897 nt11.48□□□□□ -0.57
AVL9Q12500 YFL054CYFL054C 1941 nt11.46□□□□□ -0.58
AVL9Q12500 LYS4YDR234W 2082 nt11.45□□□□□ -0.58
AVL9Q12500 YLR235CYLR235C 399 nt11.41□□□□□ -0.58
AVL9Q12500 ERF2YLR246W 1080 nt11.4□□□□□ -0.58
AVL9Q12500 FTR1YER145C 1215 nt11.38□□□□□ -0.59
AVL9Q12500 YJL225CYJL225C 5277 nt11.37□□□□□ -0.59
AVL9Q12500 ATF2YGR177C 1608 nt11.37□□□□□ -0.59
AVL9Q12500 TRM5YHR070W 1500 nt11.36□□□□□ -0.59
AVL9Q12500 GAL1YBR020W 1587 nt11.36□□□□□ -0.59
AVL9Q12500 CRR1YLR213C 1269 nt11.35□□□□□ -0.59
AVL9Q12500 TIM23YNR017W 669 nt11.35□□□□□ -0.59
AVL9Q12500 YKL030WYKL030W 606 nt11.34□□□□□ -0.59
AVL9Q12500 YLR179CYLR179C 606 nt11.33□□□□□ -0.6
AVL9Q12500 DDR2YOL052C-A 186 nt11.31□□□□□ -0.6
AVL9Q12500 MIC10YCL057C-A 294 nt11.31□□□□□ -0.6
AVL9Q12500 SPT8YLR055C 1809 nt11.3□□□□□ -0.6
AVL9Q12500 HEM12YDR047W 1089 nt11.29□□□□□ -0.6
AVL9Q12500 YFL067WYFL067W 528 nt11.29□□□□□ -0.6
AVL9Q12500 RTG1YOL067C 534 nt11.29□□□□□ -0.6
AVL9Q12500 SNG1YGR197C 1644 nt11.26□□□□□ -0.61
AVL9Q12500 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.22□□□□□ -0.61
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