Protein–RNA interactions for Protein: Q12271

INP53, Polyphosphatidylinositol phosphatase INP53, yeastyeast

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
INP53Q12271 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.92□□□□□ -0.66
INP53Q12271 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.92□□□□□ -0.66
INP53Q12271 PCH2YBR186W 1695 nt10.91□□□□□ -0.66
INP53Q12271 ART5YGR068C 1761 nt10.88□□□□□ -0.67
INP53Q12271 GFD2YCL036W 1701 nt10.88□□□□□ -0.67
INP53Q12271 GUT2YIL155C 1950 nt10.86□□□□□ -0.67
INP53Q12271 SEC11YIR022W 504 nt10.86□□□□□ -0.67
INP53Q12271 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.85□□□□□ -0.67
INP53Q12271 RTS2YOR077W 699 nt10.83□□□□□ -0.68
INP53Q12271 YGR021WYGR021W 873 nt10.8□□□□□ -0.68
INP53Q12271 YSC84YHR016C 1407 nt10.79□□□□□ -0.68
INP53Q12271 HOM6YJR139C 1080 nt10.78□□□□□ -0.68
INP53Q12271 PET9YBL030C 957 nt10.77□□□□□ -0.69
INP53Q12271 SHU1YHL006C 453 nt10.76□□□□□ -0.69
INP53Q12271 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.74□□□□□ -0.69
INP53Q12271 YHL050CYHL050C 2094 nt10.73□□□□□ -0.69
INP53Q12271 PIB2YGL023C 1908 nt10.72□□□□□ -0.69
INP53Q12271 TIR4YOR009W 1464 nt10.7□□□□□ -0.7
INP53Q12271 CUE1YMR264W 612 nt10.7□□□□□ -0.7
INP53Q12271 MNP1YGL068W 585 nt10.68□□□□□ -0.7
INP53Q12271 RRT12YCR045C 1476 nt10.67□□□□□ -0.7
INP53Q12271 YCH1YGR203W 447 nt10.65□□□□□ -0.7
INP53Q12271 YMR057CYMR057C 372 nt10.62□□□□□ -0.71
INP53Q12271 RTF1YGL244W 1677 nt10.61□□□□□ -0.71
INP53Q12271 RKM5YLR137W 1104 nt10.61□□□□□ -0.71
INP53Q12271 YIL100WYIL100W 354 nt10.55□□□□□ -0.72
INP53Q12271 YNL195CYNL195C 786 nt10.55□□□□□ -0.72
INP53Q12271 BOP3YNL042W 1191 nt10.52□□□□□ -0.73
INP53Q12271 NPL3YDR432W 1245 nt10.5□□□□□ -0.73
INP53Q12271 PTK1YKL198C 1989 nt10.48□□□□□ -0.73
INP53Q12271 YLR236CYLR236C 324 nt10.46□□□□□ -0.73
INP53Q12271 YJL152WYJL152W 360 nt10.42□□□□□ -0.74
INP53Q12271 NCP1YHR042W 2076 nt10.4□□□□□ -0.74
INP53Q12271 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.39□□□□□ -0.75
INP53Q12271 YKL097CYKL097C 411 nt10.38□□□□□ -0.75
INP53Q12271 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.36□□□□□ -0.75
INP53Q12271 YOL037CYOL037C 354 nt10.27□□□□□ -0.77
INP53Q12271 LCB1YMR296C 1677 nt10.26□□□□□ -0.77
INP53Q12271 YFL054CYFL054C 1941 nt10.25□□□□□ -0.77
INP53Q12271 SPT8YLR055C 1809 nt10.19□□□□□ -0.78
INP53Q12271 RRD1YIL153W 1182 nt10.18□□□□□ -0.78
INP53Q12271 UME6YDR207C 2511 nt10.18□□□□□ -0.78
INP53Q12271 WHI5YOR083W 888 nt10.13□□□□□ -0.79
INP53Q12271 YOR139CYOR139C 393 nt10.09□□□□□ -0.79
INP53Q12271 DED1YOR204W 1815 nt10.09□□□□□ -0.79
INP53Q12271 FMP52YER004W 696 nt10.08□□□□□ -0.8
INP53Q12271 YLR281CYLR281C 468 nt10.08□□□□□ -0.8
INP53Q12271 PCM1YEL058W 1674 nt10.07□□□□□ -0.8
INP53Q12271 IDH1YNL037C 1083 nt10.07□□□□□ -0.8
INP53Q12271 GBP2YCL011C 1284 nt10.07□□□□□ -0.8
INP53Q12271 SIM1YIL123W 1431 nt10.07□□□□□ -0.8
INP53Q12271 LYS4YDR234W 2082 nt10.05□□□□□ -0.8
INP53Q12271 FMT1YBL013W 1206 nt10.04□□□□□ -0.8
INP53Q12271 BOR1YNL275W 1731 nt10.02□□□□□ -0.8
INP53Q12271 TCD2YKL027W 1344 nt10.02□□□□□ -0.81
INP53Q12271 SWE1YJL187C 2460 nt10.01□□□□□ -0.81
INP53Q12271 ADH2YMR303C 1047 nt9.98□□□□□ -0.81
INP53Q12271 BIO4YNR057C 714 nt9.98□□□□□ -0.81
INP53Q12271 CWP1YKL096W 720 nt9.96□□□□□ -0.82
INP53Q12271 SNF6YHL025W 999 nt9.94□□□□□ -0.82
INP53Q12271 RPM1RPM1 483 nt9.94□□□□□ -0.82
INP53Q12271 MXR2YCL033C 507 nt9.89□□□□□ -0.83
INP53Q12271 HSP60YLR259C 1719 nt9.87□□□□□ -0.83
INP53Q12271 SOR2YDL246C 1074 nt9.86□□□□□ -0.83
INP53Q12271 YDR433WYDR433W 441 nt9.86□□□□□ -0.83
INP53Q12271 IMP2'YIL154C 1041 nt9.86□□□□□ -0.83
INP53Q12271 SOR1YJR159W 1074 nt9.86□□□□□ -0.83
INP53Q12271 DSK2YMR276W 1122 nt9.86□□□□□ -0.83
INP53Q12271 YJL225CYJL225C 5277 nt9.84□□□□□ -0.83
INP53Q12271 PUS2YGL063W 1113 nt9.84□□□□□ -0.83
INP53Q12271 CRR1YLR213C 1269 nt9.84□□□□□ -0.83
INP53Q12271 ERF2YLR246W 1080 nt9.84□□□□□ -0.83
INP53Q12271 YPR011CYPR011C 981 nt9.83□□□□□ -0.84
INP53Q12271 YIH1YCR059C 777 nt9.82□□□□□ -0.84
INP53Q12271 FMP45YDL222C 930 nt9.82□□□□□ -0.84
INP53Q12271 YCL042WYCL042W 360 nt9.79□□□□□ -0.84
INP53Q12271 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.78□□□□□ -0.84
INP53Q12271 YLL053CYLL053C 459 nt9.78□□□□□ -0.84
INP53Q12271 MIC10YCL057C-A 294 nt9.77□□□□□ -0.85
INP53Q12271 GLK1YCL040W 1503 nt9.76□□□□□ -0.85
INP53Q12271 ATF2YGR177C 1608 nt9.75□□□□□ -0.85
INP53Q12271 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.75□□□□□ -0.85
INP53Q12271 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.75□□□□□ -0.85
INP53Q12271 RNQ1YCL028W 1218 nt9.75□□□□□ -0.85
INP53Q12271 FRD1YEL047C 1413 nt9.74□□□□□ -0.85
INP53Q12271 HEM12YDR047W 1089 nt9.74□□□□□ -0.85
INP53Q12271 ERV46YAL042W 1248 nt9.73□□□□□ -0.85
INP53Q12271 LPX1YOR084W 1164 nt9.73□□□□□ -0.85
INP53Q12271 FUR4YBR021W 1902 nt9.73□□□□□ -0.85
INP53Q12271 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.72□□□□□ -0.85
INP53Q12271 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.72□□□□□ -0.85
INP53Q12271 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.72□□□□□ -0.85
INP53Q12271 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.72□□□□□ -0.85
INP53Q12271 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.72□□□□□ -0.85
INP53Q12271 CCA1YER168C 1641 nt9.71□□□□□ -0.85
INP53Q12271 YKR040CYKR040C 504 nt9.7□□□□□ -0.86
INP53Q12271 SNG1YGR197C 1644 nt9.7□□□□□ -0.86
INP53Q12271 RAX1YOR301W 1308 nt9.68□□□□□ -0.86
INP53Q12271 FTR1YER145C 1215 nt9.68□□□□□ -0.86
INP53Q12271 ALG12YNR030W 1656 nt9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.2 ms