Protein–RNA interactions for Protein: Q12232

SLP1, Uncharacterized protein SLP1, yeastyeast

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLP1Q12232 YDL221WYDL221W 552 nt12.56□□□□□ -0.4
SLP1Q12232 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.55□□□□□ -0.4
SLP1Q12232 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.55□□□□□ -0.4
SLP1Q12232 YBR220CYBR220C 1683 nt12.54□□□□□ -0.4
SLP1Q12232 YMR090WYMR090W 684 nt12.54□□□□□ -0.4
SLP1Q12232 RKM5YLR137W 1104 nt12.5□□□□□ -0.41
SLP1Q12232 ART5YGR068C 1761 nt12.46□□□□□ -0.41
SLP1Q12232 SDH1YKL148C 1923 nt12.46□□□□□ -0.42
SLP1Q12232 IRC15YPL017C 1500 nt12.45□□□□□ -0.42
SLP1Q12232 UME6YDR207C 2511 nt12.44□□□□□ -0.42
SLP1Q12232 GFD2YCL036W 1701 nt12.43□□□□□ -0.42
SLP1Q12232 RTS2YOR077W 699 nt12.38□□□□□ -0.43
SLP1Q12232 GIS3YLR094C 1509 nt12.37□□□□□ -0.43
SLP1Q12232 SCC4YER147C 1875 nt12.35□□□□□ -0.43
SLP1Q12232 TIR4YOR009W 1464 nt12.34□□□□□ -0.43
SLP1Q12232 GUT2YIL155C 1950 nt12.34□□□□□ -0.43
SLP1Q12232 PET9YBL030C 957 nt12.3□□□□□ -0.44
SLP1Q12232 PCH2YBR186W 1695 nt12.29□□□□□ -0.44
SLP1Q12232 YMR057CYMR057C 372 nt12.25□□□□□ -0.45
SLP1Q12232 NPL3YDR432W 1245 nt12.24□□□□□ -0.45
SLP1Q12232 YOR139CYOR139C 393 nt12.21□□□□□ -0.45
SLP1Q12232 YOL037CYOL037C 354 nt12.2□□□□□ -0.46
SLP1Q12232 YCH1YGR203W 447 nt12.19□□□□□ -0.46
SLP1Q12232 YJL152WYJL152W 360 nt12.19□□□□□ -0.46
SLP1Q12232 PIB2YGL023C 1908 nt12.19□□□□□ -0.46
SLP1Q12232 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.17□□□□□ -0.46
SLP1Q12232 CUE1YMR264W 612 nt12.16□□□□□ -0.46
SLP1Q12232 YSC84YHR016C 1407 nt12.12□□□□□ -0.47
SLP1Q12232 YGR139WYGR139W 339 nt12.08□□□□□ -0.48
SLP1Q12232 RRT12YCR045C 1476 nt12.06□□□□□ -0.48
SLP1Q12232 SEC11YIR022W 504 nt12.05□□□□□ -0.48
SLP1Q12232 YHL050CYHL050C 2094 nt12.05□□□□□ -0.48
SLP1Q12232 YIL100WYIL100W 354 nt12.02□□□□□ -0.49
SLP1Q12232 WHI5YOR083W 888 nt12.02□□□□□ -0.49
SLP1Q12232 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12□□□□□ -0.49
SLP1Q12232 YLR281CYLR281C 468 nt11.99□□□□□ -0.49
SLP1Q12232 YLR236CYLR236C 324 nt11.96□□□□□ -0.49
SLP1Q12232 YNL195CYNL195C 786 nt11.93□□□□□ -0.5
SLP1Q12232 BOR1YNL275W 1731 nt11.9□□□□□ -0.5
SLP1Q12232 MCH5YOR306C 1566 nt11.86□□□□□ -0.51
SLP1Q12232 RTF1YGL244W 1677 nt11.83□□□□□ -0.52
SLP1Q12232 IDH1YNL037C 1083 nt11.81□□□□□ -0.52
SLP1Q12232 PUS2YGL063W 1113 nt11.8□□□□□ -0.52
SLP1Q12232 GBP2YCL011C 1284 nt11.8□□□□□ -0.52
SLP1Q12232 RRD1YIL153W 1182 nt11.78□□□□□ -0.52
SLP1Q12232 PTK1YKL198C 1989 nt11.78□□□□□ -0.52
SLP1Q12232 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.75□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.75□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.75□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.75□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.75□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 YPR011CYPR011C 981 nt11.74□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 DED1YOR204W 1815 nt11.72□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 BOP3YNL042W 1191 nt11.72□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 DSK2YMR276W 1122 nt11.71□□□□□ -0.53
SLP1Q12232 TCD2YKL027W 1344 nt11.68□□□□□ -0.54
SLP1Q12232 NME1NME1 340 nt11.67□□□□□ -0.54
SLP1Q12232 NCP1YHR042W 2076 nt11.66□□□□□ -0.54
SLP1Q12232 MXR2YCL033C 507 nt11.66□□□□□ -0.54
SLP1Q12232 YDR433WYDR433W 441 nt11.65□□□□□ -0.54
SLP1Q12232 FMT1YBL013W 1206 nt11.65□□□□□ -0.54
SLP1Q12232 IMP2'YIL154C 1041 nt11.64□□□□□ -0.55
SLP1Q12232 LCB1YMR296C 1677 nt11.63□□□□□ -0.55
SLP1Q12232 FMP45YDL222C 930 nt11.61□□□□□ -0.55
SLP1Q12232 FMP52YER004W 696 nt11.58□□□□□ -0.56
SLP1Q12232 PCM1YEL058W 1674 nt11.58□□□□□ -0.56
SLP1Q12232 LPX1YOR084W 1164 nt11.57□□□□□ -0.56
SLP1Q12232 CWP1YKL096W 720 nt11.56□□□□□ -0.56
SLP1Q12232 ADH2YMR303C 1047 nt11.56□□□□□ -0.56
SLP1Q12232 ALG12YNR030W 1656 nt11.55□□□□□ -0.56
SLP1Q12232 SIM1YIL123W 1431 nt11.52□□□□□ -0.57
SLP1Q12232 ERV46YAL042W 1248 nt11.49□□□□□ -0.57
SLP1Q12232 YJL225CYJL225C 5277 nt11.49□□□□□ -0.57
SLP1Q12232 SNF6YHL025W 999 nt11.46□□□□□ -0.57
SLP1Q12232 YKR040CYKR040C 504 nt11.45□□□□□ -0.58
SLP1Q12232 SOR2YDL246C 1074 nt11.44□□□□□ -0.58
SLP1Q12232 SOR1YJR159W 1074 nt11.44□□□□□ -0.58
SLP1Q12232 YCL042WYCL042W 360 nt11.44□□□□□ -0.58
SLP1Q12232 YFL054CYFL054C 1941 nt11.44□□□□□ -0.58
SLP1Q12232 BIO4YNR057C 714 nt11.43□□□□□ -0.58
SLP1Q12232 FRD1YEL047C 1413 nt11.42□□□□□ -0.58
SLP1Q12232 HSP60YLR259C 1719 nt11.4□□□□□ -0.58
SLP1Q12232 SPT8YLR055C 1809 nt11.39□□□□□ -0.59
SLP1Q12232 LYS4YDR234W 2082 nt11.37□□□□□ -0.59
SLP1Q12232 YIH1YCR059C 777 nt11.3□□□□□ -0.6
SLP1Q12232 YLL053CYLL053C 459 nt11.29□□□□□ -0.6
SLP1Q12232 SPP1YPL138C 1062 nt11.28□□□□□ -0.6
SLP1Q12232 RNQ1YCL028W 1218 nt11.26□□□□□ -0.61
SLP1Q12232 CRR1YLR213C 1269 nt11.22□□□□□ -0.61
SLP1Q12232 ERF2YLR246W 1080 nt11.22□□□□□ -0.61
SLP1Q12232 PTH1YHR189W 573 nt11.21□□□□□ -0.61
SLP1Q12232 DIC1YLR348C 897 nt11.21□□□□□ -0.61
SLP1Q12232 ATF2YGR177C 1608 nt11.2□□□□□ -0.62
SLP1Q12232 NAR1YNL240C 1476 nt11.18□□□□□ -0.62
SLP1Q12232 MIC10YCL057C-A 294 nt11.17□□□□□ -0.62
SLP1Q12232 SWE1YJL187C 2460 nt11.16□□□□□ -0.62
SLP1Q12232 HSL7YBR133C 2484 nt11.16□□□□□ -0.62
SLP1Q12232 FTR1YER145C 1215 nt11.16□□□□□ -0.62
SLP1Q12232 TRM5YHR070W 1500 nt11.14□□□□□ -0.63
SLP1Q12232 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms