Protein–RNA interactions for Protein: Q12209

FRE8, Probable ferric reductase transmembrane component 8, yeastyeast

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE8Q12209 SIS1YNL007C 1059 nt10.57□□□□□ -0.72
FRE8Q12209 CAC2YML102W 1407 nt10.57□□□□□ -0.72
FRE8Q12209 YMR090WYMR090W 684 nt10.55□□□□□ -0.72
FRE8Q12209 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.51□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.51□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.51□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.51□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.51□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 YDL221WYDL221W 552 nt10.5□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 YBR220CYBR220C 1683 nt10.49□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 TAT1YBR069C 1860 nt10.47□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 YLR281CYLR281C 468 nt10.46□□□□□ -0.73
FRE8Q12209 FPS1YLL043W 2010 nt10.45□□□□□ -0.74
FRE8Q12209 SDH1YKL148C 1923 nt10.42□□□□□ -0.74
FRE8Q12209 ART5YGR068C 1761 nt10.41□□□□□ -0.74
FRE8Q12209 IRC15YPL017C 1500 nt10.4□□□□□ -0.74
FRE8Q12209 WHI5YOR083W 888 nt10.39□□□□□ -0.75
FRE8Q12209 GFD2YCL036W 1701 nt10.38□□□□□ -0.75
FRE8Q12209 PUS2YGL063W 1113 nt10.38□□□□□ -0.75
FRE8Q12209 PET9YBL030C 957 nt10.35□□□□□ -0.75
FRE8Q12209 SCC4YER147C 1875 nt10.33□□□□□ -0.76
FRE8Q12209 GIS3YLR094C 1509 nt10.33□□□□□ -0.76
FRE8Q12209 Q0182Q0182 405 nt10.32□□□□□ -0.76
FRE8Q12209 TIR4YOR009W 1464 nt10.3□□□□□ -0.76
FRE8Q12209 YCH1YGR203W 447 nt10.3□□□□□ -0.76
FRE8Q12209 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.28□□□□□ -0.76
FRE8Q12209 RTS2YOR077W 699 nt10.28□□□□□ -0.76
FRE8Q12209 YMR057CYMR057C 372 nt10.25□□□□□ -0.77
FRE8Q12209 IMP2'YIL154C 1041 nt10.21□□□□□ -0.77
FRE8Q12209 YJL152WYJL152W 360 nt10.2□□□□□ -0.78
FRE8Q12209 DSK2YMR276W 1122 nt10.2□□□□□ -0.78
FRE8Q12209 CUE1YMR264W 612 nt10.19□□□□□ -0.78
FRE8Q12209 SEC11YIR022W 504 nt10.16□□□□□ -0.78
FRE8Q12209 YPR011CYPR011C 981 nt10.15□□□□□ -0.78
FRE8Q12209 PCH2YBR186W 1695 nt10.15□□□□□ -0.79
FRE8Q12209 MOT3YMR070W 1473 nt10.14□□□□□ -0.79
FRE8Q12209 YLR236CYLR236C 324 nt10.13□□□□□ -0.79
FRE8Q12209 YSC84YHR016C 1407 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE8Q12209 FMP45YDL222C 930 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE8Q12209 GUT2YIL155C 1950 nt10.09□□□□□ -0.79
FRE8Q12209 YIL100WYIL100W 354 nt10.07□□□□□ -0.8
FRE8Q12209 RRT12YCR045C 1476 nt10.05□□□□□ -0.8
FRE8Q12209 YHL050CYHL050C 2094 nt10.05□□□□□ -0.8
FRE8Q12209 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.05□□□□□ -0.8
FRE8Q12209 IDH1YNL037C 1083 nt10.03□□□□□ -0.8
FRE8Q12209 YNL195CYNL195C 786 nt10.02□□□□□ -0.81
FRE8Q12209 ERV46YAL042W 1248 nt9.99□□□□□ -0.81
FRE8Q12209 LPX1YOR084W 1164 nt9.95□□□□□ -0.82
FRE8Q12209 GBP2YCL011C 1284 nt9.91□□□□□ -0.82
FRE8Q12209 PIB2YGL023C 1908 nt9.91□□□□□ -0.82
FRE8Q12209 YDR433WYDR433W 441 nt9.9□□□□□ -0.82
FRE8Q12209 RTF1YGL244W 1677 nt9.89□□□□□ -0.83
FRE8Q12209 YKR040CYKR040C 504 nt9.87□□□□□ -0.83
FRE8Q12209 RRD1YIL153W 1182 nt9.86□□□□□ -0.83
FRE8Q12209 MRPL8YJL063C 717 nt9.84□□□□□ -0.83
FRE8Q12209 BOP3YNL042W 1191 nt9.83□□□□□ -0.84
FRE8Q12209 DED1YOR204W 1815 nt9.81□□□□□ -0.84
FRE8Q12209 TCD2YKL027W 1344 nt9.81□□□□□ -0.84
FRE8Q12209 SPP1YPL138C 1062 nt9.8□□□□□ -0.84
FRE8Q12209 MXR2YCL033C 507 nt9.8□□□□□ -0.84
FRE8Q12209 UME6YDR207C 2511 nt9.76□□□□□ -0.85
FRE8Q12209 FMP52YER004W 696 nt9.76□□□□□ -0.85
FRE8Q12209 NCP1YHR042W 2076 nt9.76□□□□□ -0.85
FRE8Q12209 FMT1YBL013W 1206 nt9.75□□□□□ -0.85
FRE8Q12209 YJL225CYJL225C 5277 nt9.74□□□□□ -0.85
FRE8Q12209 PTK1YKL198C 1989 nt9.73□□□□□ -0.85
FRE8Q12209 ADO1YJR105W 1023 nt9.71□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 RTG1YOL067C 534 nt9.71□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 LCB1YMR296C 1677 nt9.71□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.7□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 YEL076CYEL076C 651 nt9.7□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 YLR464WYLR464W 651 nt9.7□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 PCM1YEL058W 1674 nt9.7□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 ADH2YMR303C 1047 nt9.67□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 FRD1YEL047C 1413 nt9.66□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 CWP1YKL096W 720 nt9.66□□□□□ -0.86
FRE8Q12209 SIM1YIL123W 1431 nt9.63□□□□□ -0.87
FRE8Q12209 SOR2YDL246C 1074 nt9.62□□□□□ -0.87
FRE8Q12209 SOR1YJR159W 1074 nt9.62□□□□□ -0.87
FRE8Q12209 SNF6YHL025W 999 nt9.61□□□□□ -0.87
FRE8Q12209 YCL042WYCL042W 360 nt9.6□□□□□ -0.87
FRE8Q12209 YFL054CYFL054C 1941 nt9.58□□□□□ -0.88
FRE8Q12209 BIO4YNR057C 714 nt9.55□□□□□ -0.88
FRE8Q12209 HUA1YGR268C 597 nt9.53□□□□□ -0.88
FRE8Q12209 YIH1YCR059C 777 nt9.51□□□□□ -0.89
FRE8Q12209 YLR235CYLR235C 399 nt9.51□□□□□ -0.89
FRE8Q12209 LYS4YDR234W 2082 nt9.51□□□□□ -0.89
FRE8Q12209 PTH1YHR189W 573 nt9.49□□□□□ -0.89
FRE8Q12209 YKL030WYKL030W 606 nt9.48□□□□□ -0.89
FRE8Q12209 SPT8YLR055C 1809 nt9.47□□□□□ -0.89
FRE8Q12209 RNQ1YCL028W 1218 nt9.47□□□□□ -0.89
FRE8Q12209 YLL053CYLL053C 459 nt9.46□□□□□ -0.9
FRE8Q12209 UBX6YJL048C 1191 nt9.43□□□□□ -0.9
FRE8Q12209 ERF2YLR246W 1080 nt9.43□□□□□ -0.9
FRE8Q12209 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.41□□□□□ -0.9
FRE8Q12209 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.41□□□□□ -0.9
FRE8Q12209 CRR1YLR213C 1269 nt9.39□□□□□ -0.91
FRE8Q12209 DIC1YLR348C 897 nt9.39□□□□□ -0.91
FRE8Q12209 YDR094WYDR094W 336 nt9.37□□□□□ -0.91
FRE8Q12209 FTR1YER145C 1215 nt9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84.4 ms