Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.38□□□□□ -0.43
TMA46Q12000 YKL097CYKL097C 411 nt12.35□□□□□ -0.43
TMA46Q12000 SDH1YKL148C 1923 nt12.33□□□□□ -0.44
TMA46Q12000 IRC15YPL017C 1500 nt12.32□□□□□ -0.44
TMA46Q12000 RKM5YLR137W 1104 nt12.3□□□□□ -0.44
TMA46Q12000 ART5YGR068C 1761 nt12.29□□□□□ -0.44
TMA46Q12000 GFD2YCL036W 1701 nt12.27□□□□□ -0.45
TMA46Q12000 PAC11YDR488C 1602 nt12.23□□□□□ -0.45
TMA46Q12000 GIS3YLR094C 1509 nt12.22□□□□□ -0.45
TMA46Q12000 SCC4YER147C 1875 nt12.22□□□□□ -0.45
TMA46Q12000 RTS2YOR077W 699 nt12.19□□□□□ -0.46
TMA46Q12000 TIR4YOR009W 1464 nt12.17□□□□□ -0.46
TMA46Q12000 PET9YBL030C 957 nt12.16□□□□□ -0.46
TMA46Q12000 YMR057CYMR057C 372 nt12.07□□□□□ -0.48
TMA46Q12000 NPL3YDR432W 1245 nt12.06□□□□□ -0.48
TMA46Q12000 YCH1YGR203W 447 nt12.06□□□□□ -0.48
TMA46Q12000 CUE1YMR264W 612 nt12.02□□□□□ -0.49
TMA46Q12000 NVJ2YPR091C 2313 nt12.02□□□□□ -0.49
TMA46Q12000 YOL037CYOL037C 354 nt12□□□□□ -0.49
TMA46Q12000 PCH2YBR186W 1695 nt11.99□□□□□ -0.49
TMA46Q12000 YSC84YHR016C 1407 nt11.98□□□□□ -0.49
TMA46Q12000 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.98□□□□□ -0.49
TMA46Q12000 YOR139CYOR139C 393 nt11.98□□□□□ -0.49
TMA46Q12000 SEC11YIR022W 504 nt11.96□□□□□ -0.49
TMA46Q12000 FPS1YLL043W 2010 nt11.96□□□□□ -0.5
TMA46Q12000 YJL152WYJL152W 360 nt11.95□□□□□ -0.5
TMA46Q12000 GUT2YIL155C 1950 nt11.95□□□□□ -0.5
TMA46Q12000 YHL050CYHL050C 2094 nt11.93□□□□□ -0.5
TMA46Q12000 RRT12YCR045C 1476 nt11.91□□□□□ -0.5
TMA46Q12000 YIL100WYIL100W 354 nt11.85□□□□□ -0.51
TMA46Q12000 WHI5YOR083W 888 nt11.82□□□□□ -0.52
TMA46Q12000 PIB2YGL023C 1908 nt11.8□□□□□ -0.52
TMA46Q12000 YLR236CYLR236C 324 nt11.8□□□□□ -0.52
TMA46Q12000 NME1NME1 340 nt11.8□□□□□ -0.52
TMA46Q12000 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.8□□□□□ -0.52
TMA46Q12000 YLR281CYLR281C 468 nt11.79□□□□□ -0.52
TMA46Q12000 YNL195CYNL195C 786 nt11.77□□□□□ -0.53
TMA46Q12000 RTF1YGL244W 1677 nt11.69□□□□□ -0.54
TMA46Q12000 RRD1YIL153W 1182 nt11.62□□□□□ -0.55
TMA46Q12000 IDH1YNL037C 1083 nt11.61□□□□□ -0.55
TMA46Q12000 BOP3YNL042W 1191 nt11.61□□□□□ -0.55
TMA46Q12000 GBP2YCL011C 1284 nt11.59□□□□□ -0.55
TMA46Q12000 NCP1YHR042W 2076 nt11.58□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 PUS2YGL063W 1113 nt11.58□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 DED1YOR204W 1815 nt11.56□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 PTK1YKL198C 1989 nt11.56□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.54□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.54□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.54□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.54□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.54□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 YPR011CYPR011C 981 nt11.54□□□□□ -0.56
TMA46Q12000 DSK2YMR276W 1122 nt11.51□□□□□ -0.57
TMA46Q12000 LCB1YMR296C 1677 nt11.5□□□□□ -0.57
TMA46Q12000 FMT1YBL013W 1206 nt11.49□□□□□ -0.57
TMA46Q12000 TCD2YKL027W 1344 nt11.49□□□□□ -0.57
TMA46Q12000 IMP2'YIL154C 1041 nt11.47□□□□□ -0.57
TMA46Q12000 FMP52YER004W 696 nt11.44□□□□□ -0.58
TMA46Q12000 MXR2YCL033C 507 nt11.44□□□□□ -0.58
TMA46Q12000 YDR433WYDR433W 441 nt11.43□□□□□ -0.58
TMA46Q12000 PCM1YEL058W 1674 nt11.43□□□□□ -0.58
TMA46Q12000 FMP45YDL222C 930 nt11.42□□□□□ -0.58
TMA46Q12000 ADH2YMR303C 1047 nt11.39□□□□□ -0.59
TMA46Q12000 CWP1YKL096W 720 nt11.36□□□□□ -0.59
TMA46Q12000 LPX1YOR084W 1164 nt11.36□□□□□ -0.59
TMA46Q12000 SIM1YIL123W 1431 nt11.35□□□□□ -0.59
TMA46Q12000 ERV46YAL042W 1248 nt11.32□□□□□ -0.6
TMA46Q12000 YFL054CYFL054C 1941 nt11.31□□□□□ -0.6
TMA46Q12000 SOR2YDL246C 1074 nt11.29□□□□□ -0.6
TMA46Q12000 SNF6YHL025W 999 nt11.29□□□□□ -0.6
TMA46Q12000 SOR1YJR159W 1074 nt11.29□□□□□ -0.6
TMA46Q12000 BIO4YNR057C 714 nt11.28□□□□□ -0.6
TMA46Q12000 YKR040CYKR040C 504 nt11.27□□□□□ -0.61
TMA46Q12000 LYS4YDR234W 2082 nt11.26□□□□□ -0.61
TMA46Q12000 FRD1YEL047C 1413 nt11.25□□□□□ -0.61
TMA46Q12000 YCL042WYCL042W 360 nt11.24□□□□□ -0.61
TMA46Q12000 UME6YDR207C 2511 nt11.23□□□□□ -0.61
TMA46Q12000 SPT8YLR055C 1809 nt11.22□□□□□ -0.61
TMA46Q12000 YIH1YCR059C 777 nt11.16□□□□□ -0.62
TMA46Q12000 YLL053CYLL053C 459 nt11.13□□□□□ -0.63
TMA46Q12000 RNQ1YCL028W 1218 nt11.12□□□□□ -0.63
TMA46Q12000 YGR139WYGR139W 339 nt11.09□□□□□ -0.63
TMA46Q12000 CRR1YLR213C 1269 nt11.09□□□□□ -0.63
TMA46Q12000 ERF2YLR246W 1080 nt11.09□□□□□ -0.63
TMA46Q12000 YJL225CYJL225C 5277 nt11.08□□□□□ -0.64
TMA46Q12000 SWE1YJL187C 2460 nt11.06□□□□□ -0.64
TMA46Q12000 SPP1YPL138C 1062 nt11.06□□□□□ -0.64
TMA46Q12000 DIC1YLR348C 897 nt11.04□□□□□ -0.64
TMA46Q12000 ATF2YGR177C 1608 nt11.04□□□□□ -0.64
TMA46Q12000 BOR1YNL275W 1731 nt11.02□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 MIC10YCL057C-A 294 nt11.02□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 FTR1YER145C 1215 nt11.01□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 PTH1YHR189W 573 nt10.98□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 GAL1YBR020W 1587 nt10.98□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 HEM12YDR047W 1089 nt10.97□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.97□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 TRM5YHR070W 1500 nt10.97□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 SNG1YGR197C 1644 nt10.96□□□□□ -0.65
TMA46Q12000 YFL067WYFL067W 528 nt10.93□□□□□ -0.66
TMA46Q12000 DDR2YOL052C-A 186 nt10.89□□□□□ -0.67
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