Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PMPCAQ10713 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMPCAQ10713 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMPCAQ10713 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMPCAQ10713 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMPCAQ10713 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMPCAQ10713 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMPCAQ10713 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMPCAQ10713 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMPCAQ10713 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMPCAQ10713 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMPCAQ10713 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PMPCAQ10713 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMPCAQ10713 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMPCAQ10713 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMPCAQ10713 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCAQ10713 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMPCAQ10713 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCAQ10713 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMPCAQ10713 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMPCAQ10713 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMPCAQ10713 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMPCAQ10713 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMPCAQ10713 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMPCAQ10713 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMPCAQ10713 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMPCAQ10713 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PMPCAQ10713 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMPCAQ10713 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMPCAQ10713 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMPCAQ10713 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMPCAQ10713 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMPCAQ10713 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMPCAQ10713 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMPCAQ10713 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMPCAQ10713 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMPCAQ10713 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMPCAQ10713 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMPCAQ10713 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMPCAQ10713 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMPCAQ10713 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCAQ10713 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCAQ10713 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMPCAQ10713 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMPCAQ10713 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMPCAQ10713 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMPCAQ10713 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMPCAQ10713 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMPCAQ10713 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMPCAQ10713 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMPCAQ10713 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMPCAQ10713 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMPCAQ10713 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMPCAQ10713 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMPCAQ10713 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMPCAQ10713 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCAQ10713 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMPCAQ10713 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMPCAQ10713 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMPCAQ10713 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMPCAQ10713 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMPCAQ10713 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMPCAQ10713 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMPCAQ10713 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMPCAQ10713 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMPCAQ10713 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMPCAQ10713 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMPCAQ10713 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PMPCAQ10713 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCAQ10713 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMPCAQ10713 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMPCAQ10713 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PMPCAQ10713 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMPCAQ10713 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMPCAQ10713 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMPCAQ10713 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCAQ10713 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMPCAQ10713 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PMPCAQ10713 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMPCAQ10713 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMPCAQ10713 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMPCAQ10713 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMPCAQ10713 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PMPCAQ10713 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMPCAQ10713 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMPCAQ10713 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMPCAQ10713 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMPCAQ10713 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMPCAQ10713 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMPCAQ10713 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMPCAQ10713 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMPCAQ10713 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMPCAQ10713 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMPCAQ10713 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMPCAQ10713 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMPCAQ10713 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMPCAQ10713 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMPCAQ10713 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMPCAQ10713 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMPCAQ10713 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
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