Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC15Q0P6D6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC15Q0P6D6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC15Q0P6D6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC15Q0P6D6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC15Q0P6D6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC15Q0P6D6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC15Q0P6D6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC15Q0P6D6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC15Q0P6D6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC15Q0P6D6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC15Q0P6D6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC15Q0P6D6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC15Q0P6D6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC15Q0P6D6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC15Q0P6D6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC15Q0P6D6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC15Q0P6D6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC15Q0P6D6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC15Q0P6D6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC15Q0P6D6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC15Q0P6D6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC15Q0P6D6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC15Q0P6D6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC15Q0P6D6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC15Q0P6D6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC15Q0P6D6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC15Q0P6D6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC15Q0P6D6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC15Q0P6D6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC15Q0P6D6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC15Q0P6D6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC15Q0P6D6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC15Q0P6D6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC15Q0P6D6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC15Q0P6D6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC15Q0P6D6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC15Q0P6D6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC15Q0P6D6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC15Q0P6D6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC15Q0P6D6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC15Q0P6D6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC15Q0P6D6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC15Q0P6D6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC15Q0P6D6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC15Q0P6D6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC15Q0P6D6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC15Q0P6D6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC15Q0P6D6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC15Q0P6D6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC15Q0P6D6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC15Q0P6D6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC15Q0P6D6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC15Q0P6D6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC15Q0P6D6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC15Q0P6D6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC15Q0P6D6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC15Q0P6D6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC15Q0P6D6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC15Q0P6D6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC15Q0P6D6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC15Q0P6D6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC15Q0P6D6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC15Q0P6D6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC15Q0P6D6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms