Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDK18Q07002 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK18Q07002 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK18Q07002 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK18Q07002 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK18Q07002 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK18Q07002 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK18Q07002 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK18Q07002 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK18Q07002 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK18Q07002 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK18Q07002 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK18Q07002 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK18Q07002 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK18Q07002 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK18Q07002 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK18Q07002 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK18Q07002 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK18Q07002 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK18Q07002 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK18Q07002 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK18Q07002 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK18Q07002 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK18Q07002 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK18Q07002 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK18Q07002 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK18Q07002 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK18Q07002 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK18Q07002 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK18Q07002 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK18Q07002 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK18Q07002 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK18Q07002 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK18Q07002 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK18Q07002 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK18Q07002 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK18Q07002 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK18Q07002 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK18Q07002 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK18Q07002 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK18Q07002 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK18Q07002 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK18Q07002 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK18Q07002 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK18Q07002 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK18Q07002 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK18Q07002 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK18Q07002 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK18Q07002 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK18Q07002 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK18Q07002 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK18Q07002 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK18Q07002 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK18Q07002 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK18Q07002 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK18Q07002 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK18Q07002 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK18Q07002 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK18Q07002 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK18Q07002 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms