Protein–RNA interactions for Protein: Q05946

UTP13, U3 small nucleolar RNA-associated protein 13, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UTP13Q05946 ALF1YNL148C 765 nt13.07□□□□□ -0.32
UTP13Q05946 YHL050CYHL050C 2094 nt13.04□□□□□ -0.32
UTP13Q05946 SIS1YNL007C 1059 nt13.02□□□□□ -0.33
UTP13Q05946 RTF1YGL244W 1677 nt12.99□□□□□ -0.33
UTP13Q05946 TRM9YML014W 840 nt12.95□□□□□ -0.34
UTP13Q05946 GFD2YCL036W 1701 nt12.93□□□□□ -0.34
UTP13Q05946 SHU1YHL006C 453 nt12.93□□□□□ -0.34
UTP13Q05946 CCT6YDR188W 1641 nt12.91□□□□□ -0.34
UTP13Q05946 PTK1YKL198C 1989 nt12.9□□□□□ -0.34
UTP13Q05946 RRT12YCR045C 1476 nt12.9□□□□□ -0.34
UTP13Q05946 ART5YGR068C 1761 nt12.89□□□□□ -0.35
UTP13Q05946 YKL097CYKL097C 411 nt12.88□□□□□ -0.35
UTP13Q05946 RTS2YOR077W 699 nt12.87□□□□□ -0.35
UTP13Q05946 BOP3YNL042W 1191 nt12.82□□□□□ -0.36
UTP13Q05946 WWM1YFL010C 636 nt12.79□□□□□ -0.36
UTP13Q05946 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.77□□□□□ -0.37
UTP13Q05946 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.77□□□□□ -0.37
UTP13Q05946 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.77□□□□□ -0.37
UTP13Q05946 LSM3YLR438C-A 270 nt12.75□□□□□ -0.37
UTP13Q05946 CUE1YMR264W 612 nt12.74□□□□□ -0.37
UTP13Q05946 PET9YBL030C 957 nt12.73□□□□□ -0.37
UTP13Q05946 YGR021WYGR021W 873 nt12.7□□□□□ -0.38
UTP13Q05946 NCP1YHR042W 2076 nt12.69□□□□□ -0.38
UTP13Q05946 FPS1YLL043W 2010 nt12.69□□□□□ -0.38
UTP13Q05946 UME6YDR207C 2511 nt12.65□□□□□ -0.38
UTP13Q05946 HOM6YJR139C 1080 nt12.62□□□□□ -0.39
UTP13Q05946 YNL195CYNL195C 786 nt12.61□□□□□ -0.39
UTP13Q05946 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.59□□□□□ -0.39
UTP13Q05946 MNP1YGL068W 585 nt12.58□□□□□ -0.4
UTP13Q05946 BOR1YNL275W 1731 nt12.56□□□□□ -0.4
UTP13Q05946 TIR4YOR009W 1464 nt12.55□□□□□ -0.4
UTP13Q05946 YCH1YGR203W 447 nt12.54□□□□□ -0.4
UTP13Q05946 YFL054CYFL054C 1941 nt12.51□□□□□ -0.41
UTP13Q05946 YIL100WYIL100W 354 nt12.51□□□□□ -0.41
UTP13Q05946 YMR057CYMR057C 372 nt12.5□□□□□ -0.41
UTP13Q05946 SPT8YLR055C 1809 nt12.5□□□□□ -0.41
UTP13Q05946 RKM5YLR137W 1104 nt12.45□□□□□ -0.42
UTP13Q05946 CSM2YIL132C 642 nt12.43□□□□□ -0.42
UTP13Q05946 YLR236CYLR236C 324 nt12.36□□□□□ -0.43
UTP13Q05946 YOR139CYOR139C 393 nt12.36□□□□□ -0.43
UTP13Q05946 LCB1YMR296C 1677 nt12.33□□□□□ -0.44
UTP13Q05946 YOL037CYOL037C 354 nt12.33□□□□□ -0.44
UTP13Q05946 NPL3YDR432W 1245 nt12.31□□□□□ -0.44
UTP13Q05946 HSP60YLR259C 1719 nt12.25□□□□□ -0.45
UTP13Q05946 SWE1YJL187C 2460 nt12.23□□□□□ -0.45
UTP13Q05946 MCH5YOR306C 1566 nt12.22□□□□□ -0.45
UTP13Q05946 ALG12YNR030W 1656 nt12.18□□□□□ -0.46
UTP13Q05946 YJL225CYJL225C 5277 nt12.13□□□□□ -0.47
UTP13Q05946 LYS4YDR234W 2082 nt12.12□□□□□ -0.47
UTP13Q05946 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.04□□□□□ -0.48
UTP13Q05946 PAU21YOR394W 495 nt12.04□□□□□ -0.48
UTP13Q05946 PAU22YPL282C 495 nt12.04□□□□□ -0.48
UTP13Q05946 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.04□□□□□ -0.48
UTP13Q05946 GLK1YCL040W 1503 nt12.04□□□□□ -0.48
UTP13Q05946 YLR281CYLR281C 468 nt12.01□□□□□ -0.49
UTP13Q05946 WHI5YOR083W 888 nt12□□□□□ -0.49
UTP13Q05946 YJL152WYJL152W 360 nt11.99□□□□□ -0.49
UTP13Q05946 ARO7YPR060C 771 nt11.96□□□□□ -0.49
UTP13Q05946 SIM1YIL123W 1431 nt11.94□□□□□ -0.5
UTP13Q05946 FUR4YBR021W 1902 nt11.91□□□□□ -0.5
UTP13Q05946 RRD1YIL153W 1182 nt11.9□□□□□ -0.5
UTP13Q05946 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.88□□□□□ -0.51
UTP13Q05946 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.88□□□□□ -0.51
UTP13Q05946 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.88□□□□□ -0.51
UTP13Q05946 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.88□□□□□ -0.51
UTP13Q05946 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.88□□□□□ -0.51
UTP13Q05946 PUS2YGL063W 1113 nt11.87□□□□□ -0.51
UTP13Q05946 BIO4YNR057C 714 nt11.87□□□□□ -0.51
UTP13Q05946 PCM1YEL058W 1674 nt11.87□□□□□ -0.51
UTP13Q05946 FMP52YER004W 696 nt11.8□□□□□ -0.52
UTP13Q05946 NAR1YNL240C 1476 nt11.8□□□□□ -0.52
UTP13Q05946 PRP4YPR178W 1398 nt11.77□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 DED1YOR204W 1815 nt11.76□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 DSK2YMR276W 1122 nt11.76□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 IDH1YNL037C 1083 nt11.75□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.74□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 YEL076CYEL076C 651 nt11.74□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 IMP2'YIL154C 1041 nt11.74□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 YLR464WYLR464W 651 nt11.74□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 FMT1YBL013W 1206 nt11.74□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 AAC1YMR056C 930 nt11.73□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 MET8YBR213W 825 nt11.73□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 DPS1YLL018C 1674 nt11.72□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.71□□□□□ -0.53
UTP13Q05946 CCA1YER168C 1641 nt11.71□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.7□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.7□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 BIO5YNR056C 1686 nt11.68□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 CRR1YLR213C 1269 nt11.67□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 ADH2YMR303C 1047 nt11.67□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 PBP1YGR178C 2169 nt11.67□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 YPR011CYPR011C 981 nt11.66□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 GBP2YCL011C 1284 nt11.66□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 SNF1YDR477W 1902 nt11.65□□□□□ -0.54
UTP13Q05946 ERF2YLR246W 1080 nt11.64□□□□□ -0.55
UTP13Q05946 SNF6YHL025W 999 nt11.62□□□□□ -0.55
UTP13Q05946 MIC10YCL057C-A 294 nt11.61□□□□□ -0.55
UTP13Q05946 FMP45YDL222C 930 nt11.6□□□□□ -0.55
UTP13Q05946 CLB6YGR109C 1143 nt11.6□□□□□ -0.55
UTP13Q05946 CWP1YKL096W 720 nt11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.9 ms