Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKCQQ04759 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKCQQ04759 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRKCQQ04759 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRKCQQ04759 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRKCQQ04759 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKCQQ04759 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKCQQ04759 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKCQQ04759 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKCQQ04759 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKCQQ04759 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKCQQ04759 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKCQQ04759 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKCQQ04759 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRKCQQ04759 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKCQQ04759 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKCQQ04759 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKCQQ04759 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKCQQ04759 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKCQQ04759 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKCQQ04759 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKCQQ04759 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKCQQ04759 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKCQQ04759 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKCQQ04759 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKCQQ04759 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKCQQ04759 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKCQQ04759 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKCQQ04759 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKCQQ04759 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKCQQ04759 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKCQQ04759 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKCQQ04759 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKCQQ04759 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKCQQ04759 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKCQQ04759 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKCQQ04759 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKCQQ04759 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKCQQ04759 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKCQQ04759 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKCQQ04759 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKCQQ04759 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCQQ04759 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKCQQ04759 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKCQQ04759 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKCQQ04759 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCQQ04759 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCQQ04759 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKCQQ04759 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCQQ04759 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCQQ04759 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCQQ04759 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCQQ04759 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKCQQ04759 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCQQ04759 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCQQ04759 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCQQ04759 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKCQQ04759 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKCQQ04759 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKCQQ04759 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKCQQ04759 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKCQQ04759 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKCQQ04759 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKCQQ04759 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKCQQ04759 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKCQQ04759 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKCQQ04759 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKCQQ04759 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKCQQ04759 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKCQQ04759 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKCQQ04759 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKCQQ04759 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRKCQQ04759 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCQQ04759 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKCQQ04759 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKCQQ04759 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKCQQ04759 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms