Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 YLR236CYLR236C 324 nt14.76□□□□□ -0.05
UBX2Q04228 ALF1YNL148C 765 nt14.76□□□□□ -0.05
UBX2Q04228 YPR011CYPR011C 981 nt14.75□□□□□ -0.05
UBX2Q04228 YJL152WYJL152W 360 nt14.66□□□□□ -0.06
UBX2Q04228 MRPL8YJL063C 717 nt14.64□□□□□ -0.07
UBX2Q04228 IDH1YNL037C 1083 nt14.55□□□□□ -0.08
UBX2Q04228 LPX1YOR084W 1164 nt14.5□□□□□ -0.09
UBX2Q04228 YDR095CYDR095C 411 nt14.48□□□□□ -0.09
UBX2Q04228 ADO1YJR105W 1023 nt14.48□□□□□ -0.09
UBX2Q04228 YPS1YLR120C 1710 nt14.47□□□□□ -0.09
UBX2Q04228 ERV46YAL042W 1248 nt14.46□□□□□ -0.09
UBX2Q04228 YDR433WYDR433W 441 nt14.44□□□□□ -0.1
UBX2Q04228 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.39□□□□□ -0.11
UBX2Q04228 SIS1YNL007C 1059 nt14.39□□□□□ -0.11
UBX2Q04228 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.38□□□□□ -0.11
UBX2Q04228 YEL076CYEL076C 651 nt14.38□□□□□ -0.11
UBX2Q04228 YLR464WYLR464W 651 nt14.38□□□□□ -0.11
UBX2Q04228 SPP1YPL138C 1062 nt14.37□□□□□ -0.11
UBX2Q04228 YKR040CYKR040C 504 nt14.33□□□□□ -0.12
UBX2Q04228 GBP2YCL011C 1284 nt14.33□□□□□ -0.12
UBX2Q04228 TIR4YOR009W 1464 nt14.31□□□□□ -0.12
UBX2Q04228 RTG1YOL067C 534 nt14.24□□□□□ -0.13
UBX2Q04228 RPP2AYOL039W 321 nt14.23□□□□□ -0.13
UBX2Q04228 UBX6YJL048C 1191 nt14.2□□□□□ -0.14
UBX2Q04228 MXR2YCL033C 507 nt14.2□□□□□ -0.14
UBX2Q04228 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.2□□□□□ -0.14
UBX2Q04228 SPT5YML010W 3192 nt14.18□□□□□ -0.14
UBX2Q04228 CAC2YML102W 1407 nt14.16□□□□□ -0.14
UBX2Q04228 ART5YGR068C 1761 nt14.12□□□□□ -0.15
UBX2Q04228 PET9YBL030C 957 nt14.12□□□□□ -0.15
UBX2Q04228 YMR057CYMR057C 372 nt14.12□□□□□ -0.15
UBX2Q04228 HUA1YGR268C 597 nt14.11□□□□□ -0.15
UBX2Q04228 TCD2YKL027W 1344 nt14.11□□□□□ -0.15
UBX2Q04228 PTP1YDL230W 1008 nt14.02□□□□□ -0.17
UBX2Q04228 GFD2YCL036W 1701 nt14.01□□□□□ -0.17
UBX2Q04228 MEP2YNL142W 1500 nt14□□□□□ -0.17
UBX2Q04228 YDR094WYDR094W 336 nt13.92□□□□□ -0.18
UBX2Q04228 FRD1YEL047C 1413 nt13.89□□□□□ -0.19
UBX2Q04228 SSA4YER103W 1929 nt13.88□□□□□ -0.19
UBX2Q04228 YCL042WYCL042W 360 nt13.87□□□□□ -0.19
UBX2Q04228 PTH1YHR189W 573 nt13.84□□□□□ -0.19
UBX2Q04228 DED1YOR204W 1815 nt13.83□□□□□ -0.2
UBX2Q04228 RRD1YIL153W 1182 nt13.83□□□□□ -0.2
UBX2Q04228 RTS2YOR077W 699 nt13.83□□□□□ -0.2
UBX2Q04228 YLR235CYLR235C 399 nt13.82□□□□□ -0.2
UBX2Q04228 YKL030WYKL030W 606 nt13.81□□□□□ -0.2
UBX2Q04228 FPS1YLL043W 2010 nt13.79□□□□□ -0.2
UBX2Q04228 DCW1YKL046C 1350 nt13.78□□□□□ -0.2
UBX2Q04228 SOR2YDL246C 1074 nt13.72□□□□□ -0.21
UBX2Q04228 SOR1YJR159W 1074 nt13.72□□□□□ -0.21
UBX2Q04228 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.71□□□□□ -0.21
UBX2Q04228 CUE1YMR264W 612 nt13.68□□□□□ -0.22
UBX2Q04228 EMI2YDR516C 1503 nt13.68□□□□□ -0.22
UBX2Q04228 FMT1YBL013W 1206 nt13.67□□□□□ -0.22
UBX2Q04228 LCB1YMR296C 1677 nt13.66□□□□□ -0.22
UBX2Q04228 FMP52YER004W 696 nt13.63□□□□□ -0.23
UBX2Q04228 YMR090WYMR090W 684 nt13.63□□□□□ -0.23
UBX2Q04228 IRC15YPL017C 1500 nt13.62□□□□□ -0.23
UBX2Q04228 YDL221WYDL221W 552 nt13.61□□□□□ -0.23
UBX2Q04228 YIL100WYIL100W 354 nt13.6□□□□□ -0.23
UBX2Q04228 CWP1YKL096W 720 nt13.6□□□□□ -0.23
UBX2Q04228 GIS3YLR094C 1509 nt13.52□□□□□ -0.25
UBX2Q04228 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.51□□□□□ -0.25
UBX2Q04228 ADH2YMR303C 1047 nt13.51□□□□□ -0.25
UBX2Q04228 TIM23YNR017W 669 nt13.51□□□□□ -0.25
UBX2Q04228 BDF1YLR399C 2061 nt13.49□□□□□ -0.25
UBX2Q04228 DIC1YLR348C 897 nt13.47□□□□□ -0.25
UBX2Q04228 RRT5YFR032C 870 nt13.46□□□□□ -0.25
UBX2Q04228 PAU16YKL224C 372 nt13.46□□□□□ -0.25
UBX2Q04228 YLR179CYLR179C 606 nt13.43□□□□□ -0.26
UBX2Q04228 YFR018CYFR018C 1092 nt13.42□□□□□ -0.26
UBX2Q04228 SNF6YHL025W 999 nt13.42□□□□□ -0.26
UBX2Q04228 PAC11YDR488C 1602 nt13.4□□□□□ -0.26
UBX2Q04228 YPR064WYPR064W 420 nt13.39□□□□□ -0.27
UBX2Q04228 PCM1YEL058W 1674 nt13.36□□□□□ -0.27
UBX2Q04228 SCC4YER147C 1875 nt13.36□□□□□ -0.27
UBX2Q04228 SBA1YKL117W 651 nt13.32□□□□□ -0.28
UBX2Q04228 SDH1YKL148C 1923 nt13.31□□□□□ -0.28
UBX2Q04228 PRE6YOL038W 765 nt13.3□□□□□ -0.28
UBX2Q04228 RNQ1YCL028W 1218 nt13.3□□□□□ -0.28
UBX2Q04228 TAD3YLR316C 969 nt13.29□□□□□ -0.28
UBX2Q04228 TAT1YBR069C 1860 nt13.28□□□□□ -0.28
UBX2Q04228 YNL195CYNL195C 786 nt13.27□□□□□ -0.29
UBX2Q04228 YIH1YCR059C 777 nt13.25□□□□□ -0.29
UBX2Q04228 AHT1YHR093W 549 nt13.19□□□□□ -0.3
UBX2Q04228 WSC2YNL283C 1512 nt13.18□□□□□ -0.3
UBX2Q04228 YBR220CYBR220C 1683 nt13.17□□□□□ -0.3
UBX2Q04228 NVJ2YPR091C 2313 nt13.14□□□□□ -0.31
UBX2Q04228 NAT4YMR069W 858 nt13.13□□□□□ -0.31
UBX2Q04228 AQY1YPR192W 918 nt13.13□□□□□ -0.31
UBX2Q04228 PEX25YPL112C 1185 nt13.12□□□□□ -0.31
UBX2Q04228 YFL066CYFL066C 1179 nt13.11□□□□□ -0.31
UBX2Q04228 YLL053CYLL053C 459 nt13.1□□□□□ -0.31
UBX2Q04228 YSC84YHR016C 1407 nt13.09□□□□□ -0.31
UBX2Q04228 GLK1YCL040W 1503 nt13.07□□□□□ -0.32
UBX2Q04228 FTR1YER145C 1215 nt13.05□□□□□ -0.32
UBX2Q04228 SIM1YIL123W 1431 nt13.05□□□□□ -0.32
UBX2Q04228 BIO4YNR057C 714 nt13.04□□□□□ -0.32
UBX2Q04228 YLR415CYLR415C 339 nt13.03□□□□□ -0.32
UBX2Q04228 GAL1YBR020W 1587 nt13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms