Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RELAQ04206 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RELAQ04206 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RELAQ04206 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RELAQ04206 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RELAQ04206 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RELAQ04206 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RELAQ04206 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RELAQ04206 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RELAQ04206 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RELAQ04206 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RELAQ04206 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RELAQ04206 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RELAQ04206 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RELAQ04206 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RELAQ04206 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RELAQ04206 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RELAQ04206 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RELAQ04206 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RELAQ04206 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RELAQ04206 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RELAQ04206 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RELAQ04206 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RELAQ04206 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RELAQ04206 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RELAQ04206 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RELAQ04206 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RELAQ04206 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RELAQ04206 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RELAQ04206 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RELAQ04206 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RELAQ04206 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RELAQ04206 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RELAQ04206 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RELAQ04206 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RELAQ04206 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RELAQ04206 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RELAQ04206 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RELAQ04206 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RELAQ04206 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RELAQ04206 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RELAQ04206 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RELAQ04206 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RELAQ04206 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RELAQ04206 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RELAQ04206 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RELAQ04206 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RELAQ04206 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RELAQ04206 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RELAQ04206 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RELAQ04206 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RELAQ04206 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RELAQ04206 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RELAQ04206 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RELAQ04206 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RELAQ04206 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RELAQ04206 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RELAQ04206 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RELAQ04206 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RELAQ04206 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RELAQ04206 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RELAQ04206 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RELAQ04206 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RELAQ04206 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RELAQ04206 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RELAQ04206 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RELAQ04206 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RELAQ04206 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RELAQ04206 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RELAQ04206 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RELAQ04206 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RELAQ04206 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RELAQ04206 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RELAQ04206 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RELAQ04206 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RELAQ04206 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RELAQ04206 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RELAQ04206 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RELAQ04206 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RELAQ04206 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RELAQ04206 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RELAQ04206 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RELAQ04206 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RELAQ04206 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RELAQ04206 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RELAQ04206 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RELAQ04206 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RELAQ04206 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RELAQ04206 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RELAQ04206 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RELAQ04206 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RELAQ04206 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RELAQ04206 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RELAQ04206 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RELAQ04206 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RELAQ04206 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RELAQ04206 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RELAQ04206 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RELAQ04206 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RELAQ04206 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms