Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DSG1Q02413 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DSG1Q02413 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
DSG1Q02413 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DSG1Q02413 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DSG1Q02413 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DSG1Q02413 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DSG1Q02413 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DSG1Q02413 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DSG1Q02413 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DSG1Q02413 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DSG1Q02413 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DSG1Q02413 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DSG1Q02413 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DSG1Q02413 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DSG1Q02413 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DSG1Q02413 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DSG1Q02413 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DSG1Q02413 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DSG1Q02413 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DSG1Q02413 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DSG1Q02413 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DSG1Q02413 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DSG1Q02413 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DSG1Q02413 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DSG1Q02413 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DSG1Q02413 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DSG1Q02413 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DSG1Q02413 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DSG1Q02413 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DSG1Q02413 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DSG1Q02413 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DSG1Q02413 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
DSG1Q02413 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DSG1Q02413 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DSG1Q02413 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
DSG1Q02413 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DSG1Q02413 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DSG1Q02413 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DSG1Q02413 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DSG1Q02413 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DSG1Q02413 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DSG1Q02413 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DSG1Q02413 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DSG1Q02413 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DSG1Q02413 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DSG1Q02413 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DSG1Q02413 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DSG1Q02413 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DSG1Q02413 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DSG1Q02413 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DSG1Q02413 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DSG1Q02413 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DSG1Q02413 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DSG1Q02413 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DSG1Q02413 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG1Q02413 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DSG1Q02413 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
DSG1Q02413 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
DSG1Q02413 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DSG1Q02413 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DSG1Q02413 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DSG1Q02413 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
DSG1Q02413 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
DSG1Q02413 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DSG1Q02413 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DSG1Q02413 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DSG1Q02413 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DSG1Q02413 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DSG1Q02413 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DSG1Q02413 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DSG1Q02413 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DSG1Q02413 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DSG1Q02413 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DSG1Q02413 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DSG1Q02413 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DSG1Q02413 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DSG1Q02413 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DSG1Q02413 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DSG1Q02413 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DSG1Q02413 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DSG1Q02413 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DSG1Q02413 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DSG1Q02413 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DSG1Q02413 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DSG1Q02413 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DSG1Q02413 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DSG1Q02413 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG1Q02413 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG1Q02413 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DSG1Q02413 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DSG1Q02413 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DSG1Q02413 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DSG1Q02413 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DSG1Q02413 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DSG1Q02413 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DSG1Q02413 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DSG1Q02413 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DSG1Q02413 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
DSG1Q02413 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms