Protein–RNA interactions for Protein: Q01113

IL9R, Interleukin-9 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL9RQ01113 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IL9RQ01113 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IL9RQ01113 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IL9RQ01113 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IL9RQ01113 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IL9RQ01113 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IL9RQ01113 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IL9RQ01113 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IL9RQ01113 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IL9RQ01113 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IL9RQ01113 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IL9RQ01113 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IL9RQ01113 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IL9RQ01113 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IL9RQ01113 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IL9RQ01113 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IL9RQ01113 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IL9RQ01113 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IL9RQ01113 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IL9RQ01113 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IL9RQ01113 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IL9RQ01113 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IL9RQ01113 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IL9RQ01113 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IL9RQ01113 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IL9RQ01113 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IL9RQ01113 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IL9RQ01113 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IL9RQ01113 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IL9RQ01113 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IL9RQ01113 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IL9RQ01113 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IL9RQ01113 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IL9RQ01113 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IL9RQ01113 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IL9RQ01113 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IL9RQ01113 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
IL9RQ01113 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IL9RQ01113 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IL9RQ01113 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IL9RQ01113 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IL9RQ01113 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IL9RQ01113 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IL9RQ01113 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IL9RQ01113 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IL9RQ01113 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IL9RQ01113 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IL9RQ01113 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
IL9RQ01113 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IL9RQ01113 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IL9RQ01113 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IL9RQ01113 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IL9RQ01113 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IL9RQ01113 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IL9RQ01113 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IL9RQ01113 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IL9RQ01113 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IL9RQ01113 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IL9RQ01113 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IL9RQ01113 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IL9RQ01113 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IL9RQ01113 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IL9RQ01113 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
IL9RQ01113 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IL9RQ01113 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IL9RQ01113 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IL9RQ01113 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IL9RQ01113 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IL9RQ01113 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IL9RQ01113 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IL9RQ01113 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms