Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SeleQ00690 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SeleQ00690 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SeleQ00690 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SeleQ00690 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SeleQ00690 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SeleQ00690 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SeleQ00690 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SeleQ00690 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SeleQ00690 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SeleQ00690 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SeleQ00690 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SeleQ00690 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SeleQ00690 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SeleQ00690 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SeleQ00690 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SeleQ00690 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SeleQ00690 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SeleQ00690 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SeleQ00690 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SeleQ00690 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SeleQ00690 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SeleQ00690 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SeleQ00690 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SeleQ00690 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SeleQ00690 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SeleQ00690 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SeleQ00690 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SeleQ00690 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SeleQ00690 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SeleQ00690 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SeleQ00690 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SeleQ00690 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SeleQ00690 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SeleQ00690 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SeleQ00690 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SeleQ00690 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SeleQ00690 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SeleQ00690 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SeleQ00690 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SeleQ00690 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SeleQ00690 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SeleQ00690 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SeleQ00690 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SeleQ00690 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SeleQ00690 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SeleQ00690 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SeleQ00690 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SeleQ00690 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SeleQ00690 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SeleQ00690 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SeleQ00690 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SeleQ00690 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SeleQ00690 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SeleQ00690 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SeleQ00690 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SeleQ00690 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SeleQ00690 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SeleQ00690 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SeleQ00690 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SeleQ00690 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SeleQ00690 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SeleQ00690 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SeleQ00690 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SeleQ00690 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SeleQ00690 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SeleQ00690 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SeleQ00690 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SeleQ00690 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SeleQ00690 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SeleQ00690 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SeleQ00690 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SeleQ00690 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SeleQ00690 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SeleQ00690 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SeleQ00690 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SeleQ00690 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SeleQ00690 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SeleQ00690 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SeleQ00690 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SeleQ00690 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SeleQ00690 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SeleQ00690 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SeleQ00690 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SeleQ00690 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SeleQ00690 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SeleQ00690 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SeleQ00690 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SeleQ00690 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SeleQ00690 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SeleQ00690 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms