Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDPQ00604 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDPQ00604 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDPQ00604 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDPQ00604 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDPQ00604 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDPQ00604 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDPQ00604 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDPQ00604 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDPQ00604 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDPQ00604 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDPQ00604 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDPQ00604 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDPQ00604 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDPQ00604 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDPQ00604 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDPQ00604 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDPQ00604 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDPQ00604 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDPQ00604 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDPQ00604 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDPQ00604 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDPQ00604 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDPQ00604 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDPQ00604 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDPQ00604 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDPQ00604 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDPQ00604 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDPQ00604 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDPQ00604 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDPQ00604 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NDPQ00604 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDPQ00604 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDPQ00604 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NDPQ00604 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDPQ00604 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDPQ00604 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDPQ00604 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDPQ00604 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDPQ00604 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDPQ00604 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDPQ00604 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDPQ00604 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDPQ00604 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDPQ00604 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDPQ00604 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDPQ00604 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDPQ00604 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDPQ00604 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDPQ00604 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDPQ00604 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDPQ00604 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDPQ00604 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDPQ00604 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDPQ00604 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDPQ00604 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDPQ00604 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDPQ00604 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDPQ00604 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDPQ00604 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDPQ00604 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDPQ00604 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDPQ00604 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDPQ00604 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDPQ00604 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDPQ00604 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDPQ00604 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDPQ00604 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDPQ00604 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDPQ00604 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDPQ00604 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDPQ00604 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDPQ00604 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDPQ00604 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDPQ00604 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDPQ00604 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDPQ00604 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDPQ00604 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDPQ00604 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDPQ00604 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDPQ00604 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDPQ00604 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDPQ00604 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDPQ00604 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDPQ00604 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDPQ00604 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDPQ00604 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDPQ00604 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDPQ00604 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDPQ00604 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDPQ00604 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDPQ00604 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDPQ00604 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDPQ00604 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDPQ00604 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDPQ00604 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDPQ00604 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDPQ00604 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDPQ00604 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDPQ00604 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms