Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC5Q00444 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC5Q00444 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC5Q00444 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC5Q00444 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC5Q00444 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC5Q00444 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC5Q00444 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC5Q00444 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC5Q00444 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC5Q00444 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC5Q00444 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC5Q00444 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC5Q00444 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC5Q00444 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC5Q00444 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC5Q00444 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC5Q00444 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC5Q00444 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC5Q00444 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC5Q00444 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC5Q00444 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC5Q00444 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC5Q00444 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC5Q00444 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC5Q00444 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC5Q00444 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC5Q00444 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXC5Q00444 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC5Q00444 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC5Q00444 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC5Q00444 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC5Q00444 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC5Q00444 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC5Q00444 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC5Q00444 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC5Q00444 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC5Q00444 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC5Q00444 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXC5Q00444 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC5Q00444 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC5Q00444 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC5Q00444 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC5Q00444 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC5Q00444 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC5Q00444 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC5Q00444 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC5Q00444 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC5Q00444 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC5Q00444 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC5Q00444 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC5Q00444 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC5Q00444 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC5Q00444 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC5Q00444 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC5Q00444 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC5Q00444 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC5Q00444 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC5Q00444 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC5Q00444 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC5Q00444 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC5Q00444 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms