Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gata5P97489 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gata5P97489 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gata5P97489 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gata5P97489 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gata5P97489 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gata5P97489 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gata5P97489 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gata5P97489 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gata5P97489 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gata5P97489 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gata5P97489 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gata5P97489 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gata5P97489 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gata5P97489 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gata5P97489 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gata5P97489 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gata5P97489 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gata5P97489 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gata5P97489 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gata5P97489 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gata5P97489 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gata5P97489 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gata5P97489 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gata5P97489 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gata5P97489 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gata5P97489 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gata5P97489 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gata5P97489 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gata5P97489 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gata5P97489 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gata5P97489 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gata5P97489 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gata5P97489 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gata5P97489 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gata5P97489 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gata5P97489 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gata5P97489 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gata5P97489 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gata5P97489 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gata5P97489 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gata5P97489 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gata5P97489 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gata5P97489 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gata5P97489 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gata5P97489 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gata5P97489 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gata5P97489 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gata5P97489 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gata5P97489 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gata5P97489 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gata5P97489 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gata5P97489 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gata5P97489 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gata5P97489 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gata5P97489 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gata5P97489 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gata5P97489 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gata5P97489 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gata5P97489 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gata5P97489 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gata5P97489 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gata5P97489 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gata5P97489 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gata5P97489 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gata5P97489 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gata5P97489 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gata5P97489 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gata5P97489 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gata5P97489 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gata5P97489 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gata5P97489 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gata5P97489 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gata5P97489 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gata5P97489 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gata5P97489 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gata5P97489 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gata5P97489 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gata5P97489 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gata5P97489 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gata5P97489 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gata5P97489 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gata5P97489 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gata5P97489 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gata5P97489 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gata5P97489 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gata5P97489 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gata5P97489 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gata5P97489 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gata5P97489 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gata5P97489 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gata5P97489 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gata5P97489 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gata5P97489 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gata5P97489 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gata5P97489 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gata5P97489 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gata5P97489 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gata5P97489 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gata5P97489 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms