Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTD2P86397 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTD2P86397 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTD2P86397 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTD2P86397 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTD2P86397 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTD2P86397 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTD2P86397 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTD2P86397 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTD2P86397 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTD2P86397 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTD2P86397 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTD2P86397 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTD2P86397 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTD2P86397 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTD2P86397 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTD2P86397 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTD2P86397 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTD2P86397 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTD2P86397 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTD2P86397 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTD2P86397 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTD2P86397 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTD2P86397 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTD2P86397 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTD2P86397 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTD2P86397 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTD2P86397 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTD2P86397 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTD2P86397 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTD2P86397 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTD2P86397 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTD2P86397 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTD2P86397 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTD2P86397 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTD2P86397 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTD2P86397 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTD2P86397 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTD2P86397 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTD2P86397 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTD2P86397 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTD2P86397 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTD2P86397 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTD2P86397 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTD2P86397 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTD2P86397 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTD2P86397 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTD2P86397 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTD2P86397 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTD2P86397 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTD2P86397 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTD2P86397 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTD2P86397 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTD2P86397 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTD2P86397 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTD2P86397 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HTD2P86397 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTD2P86397 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTD2P86397 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTD2P86397 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTD2P86397 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTD2P86397 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTD2P86397 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTD2P86397 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTD2P86397 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTD2P86397 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTD2P86397 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTD2P86397 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTD2P86397 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTD2P86397 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTD2P86397 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTD2P86397 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTD2P86397 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTD2P86397 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTD2P86397 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTD2P86397 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTD2P86397 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTD2P86397 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTD2P86397 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTD2P86397 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTD2P86397 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTD2P86397 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTD2P86397 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTD2P86397 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTD2P86397 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTD2P86397 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTD2P86397 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTD2P86397 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTD2P86397 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTD2P86397 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTD2P86397 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTD2P86397 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTD2P86397 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTD2P86397 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTD2P86397 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTD2P86397 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTD2P86397 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTD2P86397 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTD2P86397 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTD2P86397 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms