Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HpcaP84075 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HpcaP84075 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HpcaP84075 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HpcaP84075 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HpcaP84075 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HpcaP84075 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HpcaP84075 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HpcaP84075 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HpcaP84075 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HpcaP84075 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HpcaP84075 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HpcaP84075 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HpcaP84075 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HpcaP84075 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HpcaP84075 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HpcaP84075 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HpcaP84075 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HpcaP84075 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HpcaP84075 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HpcaP84075 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HpcaP84075 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HpcaP84075 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HpcaP84075 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HpcaP84075 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HpcaP84075 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HpcaP84075 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HpcaP84075 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HpcaP84075 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HpcaP84075 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HpcaP84075 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HpcaP84075 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HpcaP84075 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HpcaP84075 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HpcaP84075 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HpcaP84075 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HpcaP84075 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HpcaP84075 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HpcaP84075 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HpcaP84075 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HpcaP84075 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HpcaP84075 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HpcaP84075 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HpcaP84075 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HpcaP84075 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HpcaP84075 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HpcaP84075 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HpcaP84075 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HpcaP84075 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HpcaP84075 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HpcaP84075 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HpcaP84075 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HpcaP84075 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HpcaP84075 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HpcaP84075 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HpcaP84075 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HpcaP84075 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HpcaP84075 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HpcaP84075 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HpcaP84075 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HpcaP84075 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HpcaP84075 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HpcaP84075 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HpcaP84075 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HpcaP84075 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HpcaP84075 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HpcaP84075 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HpcaP84075 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HpcaP84075 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HpcaP84075 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HpcaP84075 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HpcaP84075 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HpcaP84075 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HpcaP84075 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HpcaP84075 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HpcaP84075 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HpcaP84075 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HpcaP84075 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HpcaP84075 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HpcaP84075 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HpcaP84075 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HpcaP84075 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HpcaP84075 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HpcaP84075 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HpcaP84075 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HpcaP84075 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HpcaP84075 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HpcaP84075 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HpcaP84075 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HpcaP84075 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HpcaP84075 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HpcaP84075 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms