Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GPC5P78333 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GPC5P78333 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GPC5P78333 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GPC5P78333 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GPC5P78333 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GPC5P78333 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GPC5P78333 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GPC5P78333 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GPC5P78333 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GPC5P78333 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GPC5P78333 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GPC5P78333 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GPC5P78333 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GPC5P78333 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GPC5P78333 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPC5P78333 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPC5P78333 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
GPC5P78333 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GPC5P78333 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GPC5P78333 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GPC5P78333 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
GPC5P78333 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GPC5P78333 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GPC5P78333 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GPC5P78333 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GPC5P78333 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GPC5P78333 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GPC5P78333 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GPC5P78333 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GPC5P78333 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GPC5P78333 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GPC5P78333 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GPC5P78333 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GPC5P78333 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GPC5P78333 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GPC5P78333 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GPC5P78333 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GPC5P78333 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GPC5P78333 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GPC5P78333 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GPC5P78333 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GPC5P78333 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GPC5P78333 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
GPC5P78333 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GPC5P78333 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GPC5P78333 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GPC5P78333 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GPC5P78333 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GPC5P78333 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GPC5P78333 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GPC5P78333 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GPC5P78333 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GPC5P78333 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GPC5P78333 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GPC5P78333 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GPC5P78333 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GPC5P78333 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GPC5P78333 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GPC5P78333 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GPC5P78333 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GPC5P78333 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GPC5P78333 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GPC5P78333 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPC5P78333 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPC5P78333 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GPC5P78333 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GPC5P78333 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC5P78333 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC5P78333 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC5P78333 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GPC5P78333 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GPC5P78333 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GPC5P78333 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GPC5P78333 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GPC5P78333 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GPC5P78333 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GPC5P78333 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC5P78333 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC5P78333 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GPC5P78333 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GPC5P78333 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GPC5P78333 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GPC5P78333 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GPC5P78333 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GPC5P78333 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GPC5P78333 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GPC5P78333 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPC5P78333 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC5P78333 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPC5P78333 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPC5P78333 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPC5P78333 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC5P78333 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GPC5P78333 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPC5P78333 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC5P78333 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC5P78333 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPC5P78333 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPC5P78333 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms