Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Irf3P70671 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Irf3P70671 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Irf3P70671 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Irf3P70671 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Irf3P70671 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Irf3P70671 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Irf3P70671 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Irf3P70671 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Irf3P70671 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Irf3P70671 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Irf3P70671 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Irf3P70671 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Irf3P70671 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Irf3P70671 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Irf3P70671 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Irf3P70671 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Irf3P70671 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Irf3P70671 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Irf3P70671 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Irf3P70671 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Irf3P70671 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Irf3P70671 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Irf3P70671 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Irf3P70671 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Irf3P70671 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irf3P70671 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Irf3P70671 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Irf3P70671 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irf3P70671 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irf3P70671 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Irf3P70671 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irf3P70671 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Irf3P70671 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irf3P70671 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irf3P70671 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Irf3P70671 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Irf3P70671 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Irf3P70671 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Irf3P70671 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Irf3P70671 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf3P70671 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf3P70671 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Irf3P70671 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Irf3P70671 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irf3P70671 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irf3P70671 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Irf3P70671 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irf3P70671 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irf3P70671 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Irf3P70671 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Irf3P70671 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Irf3P70671 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Irf3P70671 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Irf3P70671 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Irf3P70671 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Irf3P70671 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irf3P70671 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Irf3P70671 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irf3P70671 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Irf3P70671 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Irf3P70671 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Irf3P70671 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Irf3P70671 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Irf3P70671 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Irf3P70671 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Irf3P70671 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Irf3P70671 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Irf3P70671 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Irf3P70671 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Irf3P70671 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irf3P70671 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irf3P70671 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irf3P70671 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Irf3P70671 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Irf3P70671 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Irf3P70671 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Irf3P70671 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Irf3P70671 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irf3P70671 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irf3P70671 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irf3P70671 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irf3P70671 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irf3P70671 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irf3P70671 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irf3P70671 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irf3P70671 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irf3P70671 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irf3P70671 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irf3P70671 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irf3P70671 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irf3P70671 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irf3P70671 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irf3P70671 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irf3P70671 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Irf3P70671 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irf3P70671 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irf3P70671 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Irf3P70671 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irf3P70671 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 889.2 ms