Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Capza3P70190 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Capza3P70190 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Capza3P70190 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Capza3P70190 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Capza3P70190 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Capza3P70190 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Capza3P70190 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Capza3P70190 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Capza3P70190 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Capza3P70190 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Capza3P70190 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Capza3P70190 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Capza3P70190 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Capza3P70190 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Capza3P70190 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Capza3P70190 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Capza3P70190 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Capza3P70190 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Capza3P70190 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Capza3P70190 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Capza3P70190 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Capza3P70190 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Capza3P70190 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Capza3P70190 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Capza3P70190 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Capza3P70190 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Capza3P70190 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Capza3P70190 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Capza3P70190 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Capza3P70190 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Capza3P70190 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Capza3P70190 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Capza3P70190 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Capza3P70190 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Capza3P70190 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Capza3P70190 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Capza3P70190 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Capza3P70190 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Capza3P70190 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Capza3P70190 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Capza3P70190 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capza3P70190 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Capza3P70190 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Capza3P70190 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capza3P70190 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Capza3P70190 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capza3P70190 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Capza3P70190 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Capza3P70190 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Capza3P70190 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Capza3P70190 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Capza3P70190 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capza3P70190 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capza3P70190 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Capza3P70190 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capza3P70190 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capza3P70190 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Capza3P70190 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Capza3P70190 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Capza3P70190 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Capza3P70190 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Capza3P70190 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Capza3P70190 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Capza3P70190 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Capza3P70190 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Capza3P70190 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Capza3P70190 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Capza3P70190 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Capza3P70190 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Capza3P70190 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Capza3P70190 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Capza3P70190 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Capza3P70190 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Capza3P70190 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capza3P70190 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capza3P70190 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capza3P70190 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capza3P70190 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Capza3P70190 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Capza3P70190 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capza3P70190 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capza3P70190 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Capza3P70190 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Capza3P70190 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Capza3P70190 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Capza3P70190 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Capza3P70190 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capza3P70190 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capza3P70190 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Capza3P70190 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Capza3P70190 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Capza3P70190 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Capza3P70190 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capza3P70190 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capza3P70190 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Capza3P70190 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Capza3P70190 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Capza3P70190 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Capza3P70190 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms