Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL39P62891 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL39P62891 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL39P62891 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL39P62891 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL39P62891 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL39P62891 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL39P62891 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL39P62891 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL39P62891 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL39P62891 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL39P62891 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL39P62891 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL39P62891 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL39P62891 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL39P62891 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL39P62891 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL39P62891 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL39P62891 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL39P62891 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL39P62891 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL39P62891 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P62891 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL39P62891 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P62891 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL39P62891 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL39P62891 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL39P62891 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL39P62891 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL39P62891 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P62891 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P62891 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P62891 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P62891 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P62891 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P62891 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P62891 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P62891 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P62891 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P62891 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL39P62891 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL39P62891 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL39P62891 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL39P62891 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL39P62891 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P62891 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P62891 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P62891 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P62891 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P62891 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P62891 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P62891 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL39P62891 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL39P62891 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL39P62891 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P62891 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P62891 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P62891 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P62891 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P62891 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P62891 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL39P62891 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL39P62891 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL39P62891 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL39P62891 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL39P62891 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P62891 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P62891 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL39P62891 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL39P62891 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P62891 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P62891 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P62891 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P62891 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P62891 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P62891 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P62891 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P62891 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P62891 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL39P62891 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL39P62891 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL39P62891 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL39P62891 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL39P62891 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL39P62891 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL39P62891 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL39P62891 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL39P62891 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL39P62891 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL39P62891 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL39P62891 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL39P62891 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL39P62891 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL39P62891 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL39P62891 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL39P62891 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL39P62891 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL39P62891 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL39P62891 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL39P62891 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms