Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ElobP62869 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ElobP62869 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElobP62869 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ElobP62869 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ElobP62869 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ElobP62869 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ElobP62869 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ElobP62869 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ElobP62869 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ElobP62869 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ElobP62869 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ElobP62869 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ElobP62869 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ElobP62869 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ElobP62869 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ElobP62869 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ElobP62869 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ElobP62869 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ElobP62869 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ElobP62869 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ElobP62869 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ElobP62869 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ElobP62869 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ElobP62869 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ElobP62869 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ElobP62869 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ElobP62869 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ElobP62869 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ElobP62869 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ElobP62869 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ElobP62869 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ElobP62869 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ElobP62869 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ElobP62869 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ElobP62869 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ElobP62869 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ElobP62869 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ElobP62869 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ElobP62869 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ElobP62869 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ElobP62869 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ElobP62869 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ElobP62869 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElobP62869 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ElobP62869 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElobP62869 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElobP62869 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElobP62869 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ElobP62869 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ElobP62869 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElobP62869 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ElobP62869 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ElobP62869 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ElobP62869 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ElobP62869 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ElobP62869 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ElobP62869 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ElobP62869 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElobP62869 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ElobP62869 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ElobP62869 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ElobP62869 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ElobP62869 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ElobP62869 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ElobP62869 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ElobP62869 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ElobP62869 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ElobP62869 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElobP62869 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElobP62869 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ElobP62869 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ElobP62869 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ElobP62869 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ElobP62869 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ElobP62869 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ElobP62869 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ElobP62869 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ElobP62869 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ElobP62869 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ElobP62869 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ElobP62869 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ElobP62869 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ElobP62869 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ElobP62869 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ElobP62869 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ElobP62869 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElobP62869 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElobP62869 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElobP62869 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElobP62869 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElobP62869 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ElobP62869 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ElobP62869 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ElobP62869 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ElobP62869 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ElobP62869 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ElobP62869 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ElobP62869 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ElobP62869 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms