Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB8AP61006 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB8AP61006 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB8AP61006 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB8AP61006 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB8AP61006 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB8AP61006 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB8AP61006 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB8AP61006 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB8AP61006 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB8AP61006 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB8AP61006 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB8AP61006 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB8AP61006 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB8AP61006 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB8AP61006 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB8AP61006 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB8AP61006 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB8AP61006 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB8AP61006 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB8AP61006 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB8AP61006 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB8AP61006 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB8AP61006 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB8AP61006 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB8AP61006 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB8AP61006 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB8AP61006 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB8AP61006 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB8AP61006 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB8AP61006 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB8AP61006 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB8AP61006 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB8AP61006 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB8AP61006 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB8AP61006 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB8AP61006 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB8AP61006 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB8AP61006 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB8AP61006 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB8AP61006 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB8AP61006 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB8AP61006 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB8AP61006 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB8AP61006 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB8AP61006 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB8AP61006 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB8AP61006 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB8AP61006 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB8AP61006 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB8AP61006 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB8AP61006 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB8AP61006 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB8AP61006 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB8AP61006 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB8AP61006 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB8AP61006 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB8AP61006 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB8AP61006 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB8AP61006 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB8AP61006 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB8AP61006 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB8AP61006 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB8AP61006 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB8AP61006 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB8AP61006 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB8AP61006 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB8AP61006 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB8AP61006 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB8AP61006 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB8AP61006 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB8AP61006 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB8AP61006 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB8AP61006 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB8AP61006 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms