Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVPABLB-1P60509 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVPABLB-1P60509 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVPABLB-1P60509 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVPABLB-1P60509 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVPABLB-1P60509 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVPABLB-1P60509 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVPABLB-1P60509 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVPABLB-1P60509 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVPABLB-1P60509 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERVPABLB-1P60509 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVPABLB-1P60509 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVPABLB-1P60509 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVPABLB-1P60509 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVPABLB-1P60509 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVPABLB-1P60509 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVPABLB-1P60509 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVPABLB-1P60509 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVPABLB-1P60509 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVPABLB-1P60509 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVPABLB-1P60509 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVPABLB-1P60509 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVPABLB-1P60509 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERVPABLB-1P60509 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVPABLB-1P60509 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVPABLB-1P60509 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVPABLB-1P60509 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVPABLB-1P60509 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVPABLB-1P60509 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVPABLB-1P60509 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVPABLB-1P60509 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVPABLB-1P60509 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVPABLB-1P60509 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVPABLB-1P60509 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVPABLB-1P60509 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVPABLB-1P60509 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVPABLB-1P60509 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVPABLB-1P60509 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVPABLB-1P60509 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVPABLB-1P60509 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVPABLB-1P60509 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVPABLB-1P60509 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVPABLB-1P60509 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVPABLB-1P60509 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVPABLB-1P60509 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVPABLB-1P60509 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVPABLB-1P60509 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVPABLB-1P60509 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVPABLB-1P60509 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVPABLB-1P60509 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVPABLB-1P60509 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVPABLB-1P60509 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVPABLB-1P60509 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVPABLB-1P60509 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVPABLB-1P60509 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVPABLB-1P60509 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVPABLB-1P60509 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVPABLB-1P60509 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVPABLB-1P60509 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVPABLB-1P60509 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVPABLB-1P60509 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVPABLB-1P60509 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVPABLB-1P60509 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms