Protein–RNA interactions for Protein: P59759

Mkl2, MKL/myocardin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl2P59759 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mkl2P59759 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mkl2P59759 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mkl2P59759 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mkl2P59759 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mkl2P59759 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mkl2P59759 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mkl2P59759 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mkl2P59759 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Mkl2P59759 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mkl2P59759 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mkl2P59759 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mkl2P59759 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mkl2P59759 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mkl2P59759 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mkl2P59759 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mkl2P59759 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mkl2P59759 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mkl2P59759 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mkl2P59759 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mkl2P59759 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mkl2P59759 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mkl2P59759 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mkl2P59759 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mkl2P59759 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mkl2P59759 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mkl2P59759 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mkl2P59759 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mkl2P59759 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mkl2P59759 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mkl2P59759 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mkl2P59759 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mkl2P59759 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mkl2P59759 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mkl2P59759 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mkl2P59759 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mkl2P59759 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mkl2P59759 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mkl2P59759 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Mkl2P59759 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mkl2P59759 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mkl2P59759 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mkl2P59759 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Mkl2P59759 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mkl2P59759 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mkl2P59759 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Mkl2P59759 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Mkl2P59759 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mkl2P59759 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Mkl2P59759 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mkl2P59759 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mkl2P59759 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mkl2P59759 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mkl2P59759 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mkl2P59759 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Mkl2P59759 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mkl2P59759 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mkl2P59759 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mkl2P59759 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mkl2P59759 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mkl2P59759 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mkl2P59759 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mkl2P59759 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mkl2P59759 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Mkl2P59759 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mkl2P59759 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mkl2P59759 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mkl2P59759 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mkl2P59759 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Mkl2P59759 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mkl2P59759 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mkl2P59759 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mkl2P59759 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mkl2P59759 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mkl2P59759 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mkl2P59759 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mkl2P59759 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mkl2P59759 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mkl2P59759 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mkl2P59759 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mkl2P59759 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mkl2P59759 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mkl2P59759 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mkl2P59759 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mkl2P59759 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mkl2P59759 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mkl2P59759 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mkl2P59759 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mkl2P59759 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Mkl2P59759 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mkl2P59759 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mkl2P59759 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mkl2P59759 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mkl2P59759 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mkl2P59759 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mkl2P59759 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mkl2P59759 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mkl2P59759 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mkl2P59759 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Mkl2P59759 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms