Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Csrnp3P59055 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Csrnp3P59055 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Csrnp3P59055 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Csrnp3P59055 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Csrnp3P59055 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Csrnp3P59055 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Csrnp3P59055 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Csrnp3P59055 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Csrnp3P59055 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Csrnp3P59055 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Csrnp3P59055 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Csrnp3P59055 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Csrnp3P59055 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Csrnp3P59055 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Csrnp3P59055 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Csrnp3P59055 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Csrnp3P59055 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Csrnp3P59055 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Csrnp3P59055 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Csrnp3P59055 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Csrnp3P59055 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Csrnp3P59055 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Csrnp3P59055 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Csrnp3P59055 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Csrnp3P59055 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Csrnp3P59055 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Csrnp3P59055 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Csrnp3P59055 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Csrnp3P59055 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Csrnp3P59055 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Csrnp3P59055 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Csrnp3P59055 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Csrnp3P59055 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Csrnp3P59055 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Csrnp3P59055 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Csrnp3P59055 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Csrnp3P59055 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Csrnp3P59055 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Csrnp3P59055 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Csrnp3P59055 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Csrnp3P59055 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Csrnp3P59055 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Csrnp3P59055 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Csrnp3P59055 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Csrnp3P59055 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Csrnp3P59055 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Csrnp3P59055 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Csrnp3P59055 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Csrnp3P59055 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Csrnp3P59055 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Csrnp3P59055 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Csrnp3P59055 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Csrnp3P59055 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Csrnp3P59055 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Csrnp3P59055 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Csrnp3P59055 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Csrnp3P59055 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Csrnp3P59055 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Csrnp3P59055 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Csrnp3P59055 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Csrnp3P59055 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Csrnp3P59055 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Csrnp3P59055 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Csrnp3P59055 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Csrnp3P59055 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Csrnp3P59055 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Csrnp3P59055 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Csrnp3P59055 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Csrnp3P59055 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Csrnp3P59055 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Csrnp3P59055 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Csrnp3P59055 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Csrnp3P59055 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Csrnp3P59055 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Csrnp3P59055 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Csrnp3P59055 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Csrnp3P59055 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Csrnp3P59055 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Csrnp3P59055 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Csrnp3P59055 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Csrnp3P59055 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Csrnp3P59055 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Csrnp3P59055 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Csrnp3P59055 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Csrnp3P59055 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Csrnp3P59055 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Csrnp3P59055 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Csrnp3P59055 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms