Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab2aP53994 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab2aP53994 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab2aP53994 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab2aP53994 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab2aP53994 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab2aP53994 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab2aP53994 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab2aP53994 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab2aP53994 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab2aP53994 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab2aP53994 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab2aP53994 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab2aP53994 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab2aP53994 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab2aP53994 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab2aP53994 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab2aP53994 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab2aP53994 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab2aP53994 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab2aP53994 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab2aP53994 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab2aP53994 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab2aP53994 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab2aP53994 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab2aP53994 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab2aP53994 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab2aP53994 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab2aP53994 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab2aP53994 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab2aP53994 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab2aP53994 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab2aP53994 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab2aP53994 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab2aP53994 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab2aP53994 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab2aP53994 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab2aP53994 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab2aP53994 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab2aP53994 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab2aP53994 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab2aP53994 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab2aP53994 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab2aP53994 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab2aP53994 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab2aP53994 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab2aP53994 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab2aP53994 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab2aP53994 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab2aP53994 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab2aP53994 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms