Protein–RNA interactions for Protein: P53167

PUS2, tRNA pseudouridine(27/28) synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS2P53167 YJL152WYJL152W 360 nt12.93□□□□□ -0.34
PUS2P53167 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.93□□□□□ -0.34
PUS2P53167 ART5YGR068C 1761 nt12.92□□□□□ -0.34
PUS2P53167 TIR4YOR009W 1464 nt12.9□□□□□ -0.34
PUS2P53167 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.89□□□□□ -0.35
PUS2P53167 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.89□□□□□ -0.35
PUS2P53167 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.89□□□□□ -0.35
PUS2P53167 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.89□□□□□ -0.35
PUS2P53167 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.89□□□□□ -0.35
PUS2P53167 EMI2YDR516C 1503 nt12.88□□□□□ -0.35
PUS2P53167 PUS2YGL063W 1113 nt12.87□□□□□ -0.35
PUS2P53167 Q0182Q0182 405 nt12.87□□□□□ -0.35
PUS2P53167 GFD2YCL036W 1701 nt12.84□□□□□ -0.35
PUS2P53167 YCH1YGR203W 447 nt12.79□□□□□ -0.36
PUS2P53167 YMR057CYMR057C 372 nt12.79□□□□□ -0.36
PUS2P53167 RTS2YOR077W 699 nt12.79□□□□□ -0.36
PUS2P53167 YDL221WYDL221W 552 nt12.76□□□□□ -0.37
PUS2P53167 PET9YBL030C 957 nt12.74□□□□□ -0.37
PUS2P53167 IRC15YPL017C 1500 nt12.72□□□□□ -0.37
PUS2P53167 YMR090WYMR090W 684 nt12.72□□□□□ -0.37
PUS2P53167 YPR011CYPR011C 981 nt12.69□□□□□ -0.38
PUS2P53167 YLR236CYLR236C 324 nt12.68□□□□□ -0.38
PUS2P53167 DSK2YMR276W 1122 nt12.65□□□□□ -0.38
PUS2P53167 GIS3YLR094C 1509 nt12.65□□□□□ -0.38
PUS2P53167 YBR220CYBR220C 1683 nt12.62□□□□□ -0.39
PUS2P53167 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.61□□□□□ -0.39
PUS2P53167 SDH1YKL148C 1923 nt12.6□□□□□ -0.39
PUS2P53167 IDH1YNL037C 1083 nt12.58□□□□□ -0.4
PUS2P53167 FMP45YDL222C 930 nt12.56□□□□□ -0.4
PUS2P53167 SCC4YER147C 1875 nt12.56□□□□□ -0.4
PUS2P53167 FPS1YLL043W 2010 nt12.55□□□□□ -0.4
PUS2P53167 GBP2YCL011C 1284 nt12.54□□□□□ -0.4
PUS2P53167 CUE1YMR264W 612 nt12.52□□□□□ -0.41
PUS2P53167 IMP2'YIL154C 1041 nt12.51□□□□□ -0.41
PUS2P53167 YDR433WYDR433W 441 nt12.5□□□□□ -0.41
PUS2P53167 LPX1YOR084W 1164 nt12.48□□□□□ -0.41
PUS2P53167 MXR2YCL033C 507 nt12.46□□□□□ -0.41
PUS2P53167 MOT3YMR070W 1473 nt12.46□□□□□ -0.42
PUS2P53167 BDF1YLR399C 2061 nt12.42□□□□□ -0.42
PUS2P53167 YIL100WYIL100W 354 nt12.4□□□□□ -0.42
PUS2P53167 TCD2YKL027W 1344 nt12.36□□□□□ -0.43
PUS2P53167 RRD1YIL153W 1182 nt12.35□□□□□ -0.43
PUS2P53167 ERV46YAL042W 1248 nt12.34□□□□□ -0.43
PUS2P53167 DED1YOR204W 1815 nt12.34□□□□□ -0.43
PUS2P53167 RRT12YCR045C 1476 nt12.29□□□□□ -0.44
PUS2P53167 SPP1YPL138C 1062 nt12.29□□□□□ -0.44
PUS2P53167 YSC84YHR016C 1407 nt12.28□□□□□ -0.44
PUS2P53167 YKR040CYKR040C 504 nt12.28□□□□□ -0.44
PUS2P53167 FMT1YBL013W 1206 nt12.24□□□□□ -0.45
PUS2P53167 TAT1YBR069C 1860 nt12.24□□□□□ -0.45
PUS2P53167 YNL195CYNL195C 786 nt12.23□□□□□ -0.45
PUS2P53167 YHL050CYHL050C 2094 nt12.21□□□□□ -0.45
PUS2P53167 CWP1YKL096W 720 nt12.15□□□□□ -0.46
PUS2P53167 FRD1YEL047C 1413 nt12.14□□□□□ -0.47
PUS2P53167 ADH2YMR303C 1047 nt12.13□□□□□ -0.47
PUS2P53167 YCL042WYCL042W 360 nt12.13□□□□□ -0.47
PUS2P53167 PCH2YBR186W 1695 nt12.07□□□□□ -0.48
PUS2P53167 FMP52YER004W 696 nt12.07□□□□□ -0.48
PUS2P53167 SEC11YIR022W 504 nt12.07□□□□□ -0.48
PUS2P53167 PCM1YEL058W 1674 nt12.06□□□□□ -0.48
PUS2P53167 SOR2YDL246C 1074 nt12.05□□□□□ -0.48
PUS2P53167 SOR1YJR159W 1074 nt12.05□□□□□ -0.48
PUS2P53167 PTH1YHR189W 573 nt12.04□□□□□ -0.48
PUS2P53167 GUT2YIL155C 1950 nt12□□□□□ -0.49
PUS2P53167 SNF6YHL025W 999 nt12□□□□□ -0.49
PUS2P53167 SIM1YIL123W 1431 nt11.93□□□□□ -0.5
PUS2P53167 LCB1YMR296C 1677 nt11.91□□□□□ -0.5
PUS2P53167 RTG1YOL067C 534 nt11.89□□□□□ -0.51
PUS2P53167 DIC1YLR348C 897 nt11.85□□□□□ -0.51
PUS2P53167 BIO4YNR057C 714 nt11.85□□□□□ -0.51
PUS2P53167 PIB2YGL023C 1908 nt11.84□□□□□ -0.51
PUS2P53167 RTF1YGL244W 1677 nt11.82□□□□□ -0.52
PUS2P53167 YLR235CYLR235C 399 nt11.82□□□□□ -0.52
PUS2P53167 NCP1YHR042W 2076 nt11.8□□□□□ -0.52
PUS2P53167 YIH1YCR059C 777 nt11.8□□□□□ -0.52
PUS2P53167 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.79□□□□□ -0.52
PUS2P53167 YEL076CYEL076C 651 nt11.79□□□□□ -0.52
PUS2P53167 YLL053CYLL053C 459 nt11.79□□□□□ -0.52
PUS2P53167 YLR464WYLR464W 651 nt11.79□□□□□ -0.52
PUS2P53167 RNQ1YCL028W 1218 nt11.79□□□□□ -0.52
PUS2P53167 BOP3YNL042W 1191 nt11.78□□□□□ -0.52
PUS2P53167 YKL030WYKL030W 606 nt11.77□□□□□ -0.53
PUS2P53167 TIM23YNR017W 669 nt11.74□□□□□ -0.53
PUS2P53167 YLR179CYLR179C 606 nt11.72□□□□□ -0.53
PUS2P53167 MRPL8YJL063C 717 nt11.7□□□□□ -0.54
PUS2P53167 FTR1YER145C 1215 nt11.67□□□□□ -0.54
PUS2P53167 TRM5YHR070W 1500 nt11.66□□□□□ -0.54
PUS2P53167 ADO1YJR105W 1023 nt11.66□□□□□ -0.54
PUS2P53167 PTK1YKL198C 1989 nt11.66□□□□□ -0.54
PUS2P53167 HUA1YGR268C 597 nt11.65□□□□□ -0.54
PUS2P53167 GAL1YBR020W 1587 nt11.65□□□□□ -0.54
PUS2P53167 ATF2YGR177C 1608 nt11.64□□□□□ -0.55
PUS2P53167 LYS4YDR234W 2082 nt11.63□□□□□ -0.55
PUS2P53167 ERF2YLR246W 1080 nt11.6□□□□□ -0.55
PUS2P53167 WSC2YNL283C 1512 nt11.57□□□□□ -0.56
PUS2P53167 CRR1YLR213C 1269 nt11.57□□□□□ -0.56
PUS2P53167 DDR2YOL052C-A 186 nt11.56□□□□□ -0.56
PUS2P53167 MIC10YCL057C-A 294 nt11.55□□□□□ -0.56
PUS2P53167 YPR064WYPR064W 420 nt11.54□□□□□ -0.56
PUS2P53167 YFL054CYFL054C 1941 nt11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms